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很 完美

微生物组数据的置换过滤


生物导体版本:释放(3.18)

PERFect是一种新的排列过滤方法,旨在解决微生物组数据处理中两个尚未解决的问题:(i)通过实现阈值来定义和量化过滤造成的损失,以及(ii)引入和评估过滤损失的排列测试,以提供过度过滤的度量。

作者:叶卡捷琳娜·斯米尔诺娃(Ekaterina Smirnova),网址:vcuhealth.org>,Quy Cao,网址:umontana.edu>

维护人员:Quy Cao<在umontana.edu的Quy.Cao>

引文(从R中输入引文(“PERFect”)):

安装

要安装此软件包,请启动R(版本“4.3”)并输入:

如果(!require(“BiocManager”,悄悄地=TRUE))install.软件包(“BiocManager”)BiocManager::安装(“PERFect”)

对于R的旧版本,请参阅相应的生物导体释放.

文档

要查看系统中安装的此软件包版本的文档,请启动R并输入:

浏览渐晕图(“PERFect”)
方法说明 HTML格式 R脚本
参考手册 PDF格式
新闻 文本

细节

生物视图 分类,基因组,微生物组,排序,软件
版本 1.16.0
在生物导体中 生物技术3.10(R-3.6)(4.5年)
许可证 艺术-2.0
取决于 R(>=3.6.0),sn(>=1.5.2)
进口 ggplot2(>=3.0.0),品学兼优(>=1.28.0)、zoo(>=1.8.3)、psych(>=1.8)、stats(>=3.6.0)、Matrix(>=1.2.14)、fitdistrplus(>=1.0.12)、parallel(>=3.6)
系统要求
统一资源定位地址 https://github.com/cxquy91/PERFect网站
错误报告 https://github.com/cxquy91/PERFect/issues网站
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建议 knitr、rmarkdown、kableExtra、ggpubr
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程序包档案

跟随安装在您的R会话中使用此软件包的说明。

源程序包 性能_1.16.0.tar.gz
Windows二进制 性能_1.16.0.zip
macOS二进制(x86_64) 完美_1.16.0.tgz
macOS二进制(arm64) 性能_1.16.0.tgz
源码库信息 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/PERFect网站
源存储库(开发人员访问) git克隆git@git.bioconductor.org:包/PERFect
Bioc软件包浏览器 https://code.bioconductor.org/browse/PERFect网站/
包短Url https://bioconductor.org/packages/PERFect网站/
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