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NanoStringDiff(纳米字符串差异)

NanoString计数器数据的差异表达分析


生物导体版本:释放(3.18)

该软件包利用负二项族的广义线性模型(GLM)来表征计数数据,并允许多因素设计。NanoStrongDiff在模型框架中纳入了从阳性对照和内务控制中计算的尺寸系数,以及从阴性对照中获得的背景水平,以便充分利用NanoString计数器分析仪提供的所有规范化信息。

作者:uky.edu>中的hong wang<hong.wang,uky.eud>中的tingting zai<tingting.jai,uky/edu>中是chi wang<chi.wang

维护人员:婷婷斋在uky.edu>上的婷婷翟,洪旺在uky/edu>中的洪旺

引文(从R中输入引文(“NanoStringDiff”)):

安装

要安装此软件包,请启动R(版本“4.3”)并输入:

如果(!require(“BiocManager”,悄悄地=TRUE))install.packages(“BiocManager”)BiocManager::安装(“NanoStringDiff”)

对于R的旧版本,请参阅相应的生物导体释放.

文档

要查看系统中安装的此软件包版本的文档,请启动R并输入:

浏览渐晕图(“NanoStringDiff”)
NanoStringDiff渐晕图 PDF格式 R脚本
参考手册 PDF格式
新闻 文本

细节

生物视图 差异表达式,规范化,软件
版本 1.32.0
在生物导体中 生物技术3.2(R-3.2)(8.5年)
许可证 GPL公司
取决于 博科生物
进口 矩阵统计、方法、Rcpp
系统要求
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程序包档案

跟随安装在R会话中使用此包的说明。

源程序包 纳米线Diff_1.32.0.tar.gz
Windows二进制 NanoStringDiff_1.32.0.zip
macOS二进制(x86_64) 纳米线差异_1.32.0.tgz
macOS二进制(arm64) NanoStringDiff_1.32.0.tgz
源码库信息 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/NanoStringDiff
源存储库(开发人员访问) git克隆git@git.bioconductor.org:packages/NanoStringDiff
Bioc软件包浏览器 https://code.bioconductor.org/browse/NanoStringDiff/
包短Url https://bioconductor.org/packages/NanoStringDiff/
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