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MWA工具

MWA工具:执行代谢组范围关联研究的集成管道


生物导体版本:释放(3.18)

MWATools提供了一个完整的管道来执行代谢组范围的关联研究。该软件包的关键功能包括:代谢组数据的质量控制分析;使用不同关联模型的MWAS(偏相关;广义线性模型);非参数自举模型验证;MWAS结果可视化;核磁共振代谢产物的STOCSY鉴定;以及MWAS结果的生物学解释。

作者:安德烈亚·罗德里格斯·马丁内斯(Andrea Rodriguez-Martinez)、乔拉姆·波斯马(Joram M.Posma)、拉斐尔·阿亚拉(Rafael Ayala)、安娜·内维斯(Ana L.Neves)、玛丽亚姆·安瓦尔(Maryam Anwar)、杰里米·尼克尔森

维护人员:安德烈亚·罗德里格斯-马丁内兹(Andrea Rodriguez-Martinez)<Andrea.Rodriguez-martinez13 at imperial.ac.uk>,拉斐尔·阿亚拉(Rafael Ayala)<Rafael.Ayala at oist.jp>

引文(从R中输入引文(“MWATools”)):

安装

要安装此软件包,请启动R(版本“4.3”)并输入:

如果(!require(“BiocManager”,悄悄地=TRUE))install.packages(“BiocManager”)BiocManager::install(“MWATools”)

对于R的旧版本,请参阅相应的生物导体释放.

文档

要查看系统中安装的此软件包版本的文档,请启动R并输入:

浏览幻影(“MWATools”)
MWA工具 HTML格式 R脚本
参考手册 PDF格式
新闻 文本

细节

生物视图 化学信息学,脂质组学,代谢组学,质量控制,软件,系统生物学
版本 1.26.0
在生物导体中 生物活性炭3.5(R-3.4)(7年)
许可证 抄送BY-NC-ND 4.0
取决于 R(>=3.5.0)
进口 glm2、ppcor、,q值、car、boot、grid、ggplot2、gridExtra、igraph、,总结性实验,KEG图形、RCurl、,KEGGREST公司,复杂热图,统计,实用程序
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程序包档案

跟随安装在R会话中使用此包的说明。

源程序包 MWA工具_1.26.0.tar.gz
Windows二进制 MWA工具_1.26.0.zip
macOS二进制(x86_64) MWA工具_1.26.0.tgz
macOS二进制(arm64) MWA工具_1.26.0.tgz
源码库信息 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/MWA工具
源存储库(开发人员访问) git克隆git@git.bioconductor.org:包/MWA工具
Bioc软件包浏览器 https://code.bioconductor.org/browse/MWA工具/
包短Url https://bioconductor.org/packages/MWA工具/
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