InterMineR公司
与InterMine-Powered数据库的R接口
生物导体版本：释放（3.18）
基于InterMine平台的数据库，如FlyMine、modMine（modENCODE）、RatMine、YeastMine、HumanMine和TargetMine，是各种生物体基因组、表达和蛋白质数据的集成数据库。通过集成数据，可以运行跨越生物知识领域的复杂数据挖掘查询。这个R包通过Web服务提供与这些数据库的接口。它充分利用了R中数据帧对象和数据库中表对象的对应关系，同时通过XML或JSON隐藏了数据交换的细节。
作者：Bing Wang、Julie Sullivan、Rachel Lyne、Konstantinos Kyritsis、Celia Sanchez
维护人员：InterMine团队<r.lyne at gen.cam.ac.uk>
引文（从R中输入引文（“InterMineR”）):
安装
要安装此软件包，请启动R（版本“4.3”）并输入：
如果（！require（“BiocManager”，悄悄地=TRUE））install.packages（“BiocManager”）BiocManager:：安装（“InterMineR”）
对于R的旧版本，请参阅相应的生物导体释放.
文档
要查看系统中安装的此软件包版本的文档，请启动R并输入：
浏览幻影（“InterMineR”）
细节
| 生物视图 |
交替拼接,比较基因组学,微分表达式,功能基因组学,功能预测,GO（开始）,基因表达,基因调控,GeneSet扩展,基因组注释,基因组广泛协会,KEGG公司,微阵列,多重比较,路径,蛋白质组学,反应途径,SNP公司,软件,系统生物学,可视化 |
| 版本 |
1.24.0 |
| 在生物导体中 |
生物技术3.6（R-3.4）（6.5年） |
| 许可证 |
LGPL公司 |
| 取决于 |
R（>=3.4.1） |
| 进口 |
生物串、RCurl、XML、xml2、RJSONIO、sqldf、igraph、httr、，S4载体,I范围,基因组学范围,总结性实验，方法 |
| 系统要求 |
|
| 统一资源定位地址 |
|
| 错误报告 |
https://github.com/interline/interneR/issues |
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程序包档案
跟随安装在R会话中使用此包的说明。
