InPAS公司
从RNA-seq数据中识别新的替代聚腺苷酸位点(PAS)
生物导体版本:释放(3.18)
选择性多腺苷酸化(APA)是发生在大多数人类基因中的重要转录后调控机制之一。InPAS有助于从RNA-Seq数据中发现新的APA位点和APA位点的差异使用。它利用cleanUpdTSeq通过删除虚假站点来微调已识别的APA站点。
作者:欧建宏[aut,cre],刘海波[aut],朱丽叶[aut]Lihua Julie Zhu,Sungmi M.Park[aut',Michael R.Green[aut]
维护人员:欧建宏(Jianhong Ou)<杜克教育学院的欧建宏>
安装
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if(!require(“生物管理器”,悄悄=TRUE))install.packages(“BiocManager”)BiocManager::安装(“InPAS”)
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文件
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浏览幻影(“InPAS”)
细节
生物视图 |
选择性聚腺苷化,聚腺苷酸化位点的差异使用,基因调控,转录组测序,软件,转录 |
版本 |
2.10.0 |
在生物导体中 |
生物技术3.1(R-3.2)(9年) |
许可证 |
GPL(>=2) |
取决于 |
R(>=3.5.0) |
进口 |
注释Dbi、批处理工具、,博科生物,生物串,牛基因组,清理上TSeq、depmixS4、dplyr、flock、future、future.apply、,基因组信息Db,基因组范围,基因组特征,ggplot2,I范围,利马,magrittr,方法,并行,plyranges系列,预处理核心,读卡器,重塑2,RSQLite,统计,S4载体,实用程序 |
系统要求 |
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统一资源定位地址 |
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