HGC公司
一种基于层次图的快速聚类方法
生物导体版本：释放（3.18）
HGC（Hierarchical Graph-based Clustering的缩写）是一个R包，用于对大规模单细胞RNA-seq数据进行分层聚类。其关键思想是在共享最近邻（SNN）图上构建细胞的树状图。HGC提供了构建图形和对图形进行层次聚类的功能。旧R版本的用户可以访问https://github.com/学宫实验室/HGC/tree/HGC4oldRVersion为R 3.6构建HGC包。
作者：邹子恒[aut]，华奎[aut]XGlab[cre，cph]
维护人员：XGlab<XGlab at mail.tsinghua.edu.cn>
安装
要安装此软件包，请启动R（版本“4.3”）并输入：
如果（！require（“BiocManager”，悄悄地=TRUE））install.软件包（“BiocManager”）生物管理器：：安装（“HGC”）
对于R的旧版本，请参阅相应的生物导体释放.
文档
要查看系统中安装的此软件包版本的文档，请启动R并输入：
浏览幻影（“HGC”）
细节
| 生物视图 |
群集,DNASeq公司,图形和网络,RNA序列,单个单元格,软件 |
| 版本 |
1.10.0 |
| 在生物导体中 |
生物化学3.13（R-4.1）（3年） |
| 许可证 |
GPL-3公司 |
| 取决于 |
R（>=4.1.0） |
| 进口 |
Rcpp（>=1.0.0），RcppEigen（>=0.3.2.0），矩阵，RANN，ape，dendextend，ggplot2，mclust，补丁，dplyr，grDevices，methods，stats |
| 系统要求 |
C++11 |
| 统一资源定位地址 |
|
查看更多
| 建议 |
生物风格、rmarkdown、knitr、testtat（>=3.0.0） |
| 链接到 |
Rcpp、RcppEigen |
| 增强功能 |
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| 取决于我 |
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| 导入我 |
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| 建议我 |
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| 指向我的链接 |
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| 生成报告 |
生成报告 |
程序包档案
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