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GOSim公司

GO术语与基因产物功能相似性的计算;GO富集分析


生物导体版本:释放(3.18)

这个包实现了几个函数,这些函数用于根据GO注释计算GO术语和基因产品之间的相似性。此外,它允许计算GO富集分析

作者:Holger Froehlich<frohlich at bit.uni-bonn.de>

维护人员:Holger Froehlich<frohlich at bit.uni-bonn.de>

引文(从R中输入引文(“GOSim”)):

安装

要安装此软件包,请启动R(版本“4.3”)并输入:

if(!require(“生物管理器”,悄悄=TRUE))install.packages(“BiocManager”)生物管理器::安装(“GOSim”)

对于R的旧版本,请参阅相应的生物导体释放.

文件

要查看系统中安装的此软件包版本的文档,请启动R并输入:

浏览幻影(“GOSim”)
戈西姆 PDF格式 R脚本
参考手册 PDF格式

细节

生物视图 聚类,GO(开始),路径,软件
版本 1.40.0
在生物导体中 生物技术2.13(R-3.0)(10.5年)
许可证 GPL(>=2)
取决于 政府.db,注释
进口 组织Hs.eg.db,注释Dbi,topGO(顶GO)、集群、flexmix、,苏格兰皇家银行,图表、矩阵、corpcor、Rcpp
系统要求
统一资源定位地址
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程序包档案

跟随安装在R会话中使用此包的说明。

源程序包 俄罗斯国家标准_1.40.0.tar.gz
Windows二进制 GOSim_1.40.0.zip公司
macOS二进制(x86_64) GOSim_1.40.0.tgz
macOS二进制(arm64) 戈西姆_1.40.0.tgz
源码库信息 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/GOSim
源存储库(开发人员访问) git克隆git@git.bioconductor.org:包装/GOSim
Bioc软件包浏览器 https://code.bioconductor.org/browse/GOSim网站/
包短Url https://bioconductor.org/packages/GOSim/
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