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GA4GH客户端

用于访问GA4GH API数据服务器的Bioconductor包


生物导体版本:释放(3.18)

GA4GHclient通过全球基因组与健康联盟(GA4GH)基因组API提供了访问公共数据服务器的简单方法。它提供对GA4GH API的低级访问,并将响应数据转换为基于Bioconductor的类对象。

作者:Welliton Souza[aut,cre]、Benilton Carvalho[ctb]、Cristiane Rocha[ctb]

维护人员:Welliton Souza<gmail.com上的well309>

引文(从R中输入引文(“GA4GHclient”)):

安装

要安装此软件包,请启动R(版本“4.3”)并输入:

如果(!require(“BiocManager”,悄悄地=TRUE))install.packages(“BiocManager”)BiocManager::安装(“GA4GH客户端”)

对于R的旧版本,请参阅相应的生物导体释放.

文档

要查看系统中安装的此软件包版本的文档,请启动R并输入:

浏览幻影(“GA4GH客户端”)
GA4GH客户端 HTML格式 R脚本
参考手册 PDF格式
新闻 文本

细节

生物视图 数据表示,软件,第三方客户
版本 1.26.0
在生物导体中 生物活性炭3.5(R-3.4)(7年)
许可证 GPL(>=2)
取决于 R(>=3.5.0),S4载体
进口 生物遗传学,生物管柱、dplyr、,基因组信息Db,基因组范围,高温气冷堆,I范围,jsonlite,方法,变量注释
系统要求
统一资源定位地址 https://github.com/labbcb/GA4GH客户端
错误报告 https://github.com/labbcb/GA4GH客户端/问题
查看更多
建议 注释Dbi,仿生风格、DT、knitr、,组织Hs.eg.db,rmarkdown,测试,TxDb(发送日期)。哈皮恩斯。UCSC.hg19.known基因
链接到
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取决于我 GA4GH小巧
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程序包档案

跟随安装在R会话中使用此包的说明。

源程序包 GA4GH客户端_1.26.0.tar.gz
Windows二进制 GA4GH客户端_1.26.0.zip(仅64位)
macOS二进制(x86_64) GA4GH客户端_1.26.0.tgz
macOS二进制(arm64) GA4GH客户端_1.26.0.tgz
源码库信息 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/GA4GH客户端
源存储库(开发人员访问) git克隆git@git.bioconductor.org:包/GA4GH客户端
Bioc软件包浏览器 https://code.bioconductor.org/browse/GA4GH客户端/
包短Url https://bioconductor.org/packages/GA4GH客户端/
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