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经验性布朗方法

使用Brown的方法组合依赖测试的p值


生物导体版本:释放(3.18)

组合来自多个统计测试的P值在生物信息学中很常见。然而,该程序对于依赖的P值来说并不常见。该软件包实现了Brown方法(Fisher方法的扩展)的经验改编,用于组合相关的P值,适用于高通量生物实验中发现的高度相关的数据集。

作者:威廉·普尔

维护人员:David Gibbs<systemsbiology.org上的dgibbs>

引文(从R中输入引文(“经验布朗方法”)):

安装

要安装此软件包,请启动R(版本“4.3”)并输入:

如果(!require(“BiocManager”,悄悄地=TRUE))install.软件包(“BiocManager”)BiocManager::install(“经验布朗方法”)

对于R的旧版本,请参阅相应的生物导体释放.

文档

要查看系统中安装的此软件包版本的文档,请启动R并输入:

浏览渐晕图(“经验性布朗方法”)
经验布朗方法 HTML格式 R脚本
参考手册 PDF格式
新闻 文本
许可证 文本

细节

生物视图 基因表达式,路径,软件,统计方法
版本 1.30.0
在生物导体中 生物多样性3.3(R-3.3)(8年)
许可证 MIT+文件许可证
取决于 R(>=3.2.0)
进口
系统要求
统一资源定位地址 https://github.com/IlyaLab/CombiningDependentP值使用EBM.git
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程序包档案

跟随安装在您的R会话中使用此软件包的说明。

源程序包 经验性布朗方法_1.30.0.tar.gz
Windows二进制 经验布朗方法_1.30.0.zip
macOS二进制(x86_64) 经验性布朗方法_1.30.0.tgz
macOS二进制(arm64) 经验性布朗方法_1.30.0.tgz
源码库信息 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/EmpiricalBrownsMethod公司
源存储库(开发人员访问) git克隆git@git.bioconductor.org:软件包/EmpiricalBrownsMethod
Bioc软件包浏览器 https://code.bioconductor.org/browse/EmpiricalBrownsMethod网站/
包短Url https://bioconductor.org/packages/EmpiricalBrownsMethod公司/
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