DegNorm(度正常)
DegNorm:RNA-seq数据的退化归一化
生物导体版本:释放(3.18)
该软件包对大量RNA-seq数据进行降解归一化,以提高差异表达分析的准确性。
作者:熊斌和王继平
维护人员:王继平(Ji-Ping Wang)<jzwang at northwesth.edu>
安装
要安装此软件包,请启动R(版本“4.3”)并输入:
如果(!require(“BiocManager”,悄悄地=TRUE))install.packages(“BiocManager”)BiocManager::安装(“DegNorm”)
对于R的旧版本,请参阅相应的生物导体释放.
文档
要查看系统中安装的此软件包版本的文档,请启动R并输入:
浏览渐晕图(“DegNorm”)
细节
生物视图 |
对齐,BatchEffect(批次效果),新闻报道,数据导入,差异表达式,基因表达式,免疫肿瘤学,规范化,质量控制,RNA序列,排序,软件 |
版本 |
1.12.0 |
在生物导体中 |
生物柴油3.12(R-4.0)(3.5年) |
许可证 |
LGPL(>=3) |
取决于 |
R(>=4.0.0),方法 |
进口 |
Rcpp(>=1.0.2),基因组特征、平行、前后,S4载体,do并行,Rsamtools软件(>= 1.31.2),基因组比对,热铺,数据表,统计,ggplot2,基因组范围,I范围,plyr,plotly,utils,翡翠 |
系统要求 |
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统一资源定位地址 |
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错误报告 |
https://github.com/jipingw/DegNorm/issues网站 |
查看更多
建议 |
knitr、rmarkdown、formatR |
链接到 |
Rcpp、RcppArmadillo、,S4载体,I范围 |
增强功能 |
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取决于我 |
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导入我 |
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建议我 |
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指向我的链接 |
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生成报告 |
生成报告 |
程序包档案
跟随安装在R会话中使用此包的说明。