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DegNorm(度正常)

DegNorm:RNA-seq数据的退化归一化


生物导体版本:释放(3.18)

该软件包对大量RNA-seq数据进行降解归一化,以提高差异表达分析的准确性。

作者:熊斌和王继平

维护人员:王继平(Ji-Ping Wang)<jzwang at northwesth.edu>

引文(从R中输入引文(“DegNorm”)):

安装

要安装此软件包,请启动R(版本“4.3”)并输入:

如果(!require(“BiocManager”,悄悄地=TRUE))install.packages(“BiocManager”)BiocManager::安装(“DegNorm”)

对于R的旧版本,请参阅相应的生物导体释放.

文档

要查看系统中安装的此软件包版本的文档,请启动R并输入:

浏览渐晕图(“DegNorm”)
DegNorm(度正常) HTML格式 R脚本
参考手册 PDF格式
新闻 文本

细节

生物视图 对齐,BatchEffect(批次效果),新闻报道,数据导入,差异表达式,基因表达式,免疫肿瘤学,规范化,质量控制,RNA序列,排序,软件
版本 1.12.0
在生物导体中 生物柴油3.12(R-4.0)(3.5年)
许可证 LGPL(>=3)
取决于 R(>=4.0.0),方法
进口 Rcpp(>=1.0.2),基因组特征、平行、前后,S4载体,do并行,Rsamtools软件(>= 1.31.2),基因组比对,热铺,数据表,统计,ggplot2,基因组范围,I范围,plyr,plotly,utils,翡翠
系统要求
统一资源定位地址
错误报告 https://github.com/jipingw/DegNorm/issues网站
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程序包档案

跟随安装在R会话中使用此包的说明。

源程序包 度标准_1.12.0.tar.gz
Windows二进制 DegNorm_1.12.0.zip标准
macOS二进制(x86_64) DegNorm_1.12.0.tgz摄氏度
macOS二进制(arm64) DegNorm_1.12.0.tgz摄氏度
源码库信息 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/DegNorm
源存储库(开发人员访问) git克隆git@git.bioconductor.org:包装/DegNorm
Bioc软件包浏览器 https://code.bioconductor.org/browse/DegNorm网站/
包短Url https://bioconductor.org/packages/DegNorm/
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