环境质量管理体系

用于对定量蛋白质组数据的差异蛋白质表达进行统计分析的工具。

生物导体版本：释放（3.18）

DEqMS是在Limma之上开发的。然而，Limma假设所有基因的先验方差相同。在蛋白质组学中，蛋白质丰度估计的准确性因无标签数据和标记数据中量化的肽/PSM数量而异。通过多种肽或PSM对蛋白质进行定量更准确。DEqMS软件包能够估计由不同数量的PSM/肽量化的蛋白质的不同先验方差，因此具有更好的准确性。该软件包可用于分析无标签和标记蛋白质组学数据。

作者：朱亚峰

维护人员：朱亚峰<outlook.com>上的朱亚峰

引文（从R中输入引文（“DEqMS”）):

安装

要安装此软件包，请启动R（版本“4.3”）并输入：

如果（！require（“BiocManager”，悄悄地=TRUE））install.packages（“BiocManager”）BiocManager:：安装（“DEqMS”）

对于旧版本的R，请参阅相应的生物导体释放.

文件

要查看系统中安装的此软件包版本的文档，请启动R并输入：

浏览渐晕图（“DEqMS”）

DEqMS R降价案例	HTML格式	R脚本
参考手册	PDF格式
新闻	文本

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细节

生物视图	贝叶斯主义者,微分表达式,实验中心软件,免疫肿瘤学,质谱学,多重比较,规范化,预处理,蛋白质组学,软件
版本	1.20.0
在生物导体中	生物技术3.8（R-3.5）（5.5年）
许可证	LGPL公司
取决于	R（>=3.5），图形，统计，ggplot2，矩阵统计，利马(>= 3.34)
进口
系统要求
统一资源定位地址
错误报告	https://github.com/yafeng/DEqMS/issues网站

建议	仿生风格、knitr、rmarkdown、markdown、plyr、reformate2、，农场，utils，ggexist，实验中心、LSD
链接到
增强功能
取决于我
导入我
建议我
指向我的链接
生成报告	生成报告

程序包档案

跟随安装在R会话中使用此包的说明。

源程序包	数据元素_1.20.0.tar.gz
Windows二进制	DEqMS_1.20.0.zip文件
macOS二进制（x86_64）	数据元素_1.20.0.tgz
macOS二进制（arm64）	数据元素_1.20.0.tgz
源码库信息	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/DEqMS
源存储库（开发人员访问）	git克隆git@git.bioconductor.org：包/DEqMS
Bioc软件包浏览器	https://code.bioconductor.org/browse/DEqMS网站/
包短Url	https://bioconductor.org/packages/DEqMS/
软件包下载报告	下载统计信息