脆皮RVariants

用于计算和可视化目标位置突变的工具

生物导体版本：释放（3.18）

CrispRVariants提供了分析CRISPR-Cas9诱变测序实验或其他测序实验结果的工具，其中特定区域内的变体具有重要意义。这些工具允许用户定位与任何基因组位置相关的变异等位基因组合（例如Cas9切割位点），绘制等位基因的组合图，并通过灵活过滤无关变体计算突变率。

作者：海伦·林赛

维护人员：海伦·林赛（Helen Lindsay）<Helen.Lindsay at chuv.ch>

引文（从R中输入引文（“CrispRVariants”）):

要安装此软件包，请启动R（版本“4.3”）并输入：

如果（！require（“BiocManager”，悄悄地=TRUE））install.packages（“BiocManager”）BiocManager:：安装（“CrispRVariants”）

对于R的旧版本，请参阅相应的生物导体释放.

要查看系统中安装的此软件包版本的文档，请启动R并输入：

浏览幻影（“CrispRVariants”）

生物视图	CRISPR公司,数据表示,遗传变异性,基因组变异,免疫肿瘤学,排序,软件,变量检测,可视化
版本	1.30.0
在生物导体中	生物多样性3.3（R-3.3）（8年）
许可证	GPL-2型
取决于	R（>=4.3.0），ggplot2（>=2.2.0）
进口	注释Dbi,生物并行,生物串、方法、，基因组信息Db,基因组比对,基因组范围，grDevices，网格，gridExtra，I范围，重塑2，Rsamtools软件,S4载体（>=0.9.38），实用工具
系统要求
统一资源定位地址

建议	仿生风格,基因组特征、knitr、rmarkdown、readxl、，rtracklayer公司,sangerseqR公司，测试，变量注释
链接到
增强功能
取决于我
导入我
建议我
指向我的链接
生成报告	生成报告

跟随安装在R会话中使用此包的说明。

源程序包	CrispR变量_1.30.0.tar.gz
Windows二进制	脆皮RVariants_1.30.0.zip
macOS二进制（x86_64）	脆R变体_1.30.0.tgz
macOS二进制（arm64）	脆皮RVariants_1.30.0.tgz
源码库信息	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/CrispRVariants网站
源存储库（开发人员访问）	git克隆git@git.bioconductor.org：套餐/CrispRVariants
Bioc软件包浏览器	https://code.bioconductor.org/browse/CrispRVariants网站/
包短Url	https://bioconductor.org/packages/CrispRVariants网站/
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