CNV电池

靶向测序应用中可靠的CNV检测

生物导体版本：释放（3.18）

一种允许使用非匹配正常组织样本集合的方法。我们的方法使用可用参考样本的非参数自举子抽样来估计目标测序的读取计数分布。受随机森林的启发，这与对每个目标基因相关的扩增子进行子取样的程序相结合。获得的信息使我们能够在基因水平上可靠地对拷贝数畸变进行分类。

作者：克里斯蒂亚诺·奥利维拉【aut】、托马斯·沃尔夫【aut，cre】、阿尔布雷希特·斯坦辛格【ctb】、沃尔克·恩德里斯【ctb）、妮可·普法尔【ctb」、贝内迪克特·布罗斯【ths】、威尔科·威切特【ths）

维护人员：托马斯·沃尔夫（Thomas Wolf）<Thomas_wolf71 at gmx.de>

引文（从R中输入引文（“CNVPanelizer”）):

要安装此软件包，请启动R（版本“4.3”）并输入：

如果（！require（“BiocManager”，悄悄地=TRUE））install.packages（“BiocManager”）BiocManager:：安装（“CNVPanelizer”）

对于R的旧版本，请参阅相应的生物导体释放.

要查看系统中安装的此软件包版本的文档，请启动R并输入：

浏览渐晕图（“CNVPanelizer”）

生物视图	分类,副本编号变化,新闻报道,规范化,排序,软件
版本	1.34.0
在生物导体中	生物技术3.2（R-3.2）（8.5年）
许可证	GPL-3公司
取决于	R（>=3.2.0），基因组范围
进口	生物遗传学,S4载体、grDevices、stats、utils、，NOISeq公司,I范围,Rsamtools软件,exome副本、foreach、ggplot2、plyr、，基因组信息Db，gplots，restructe2，stringr，testtat，graphics，methods，shiny，shiny文件，shiny js，网格，openxlsx
系统要求
统一资源定位地址

跟随安装在R会话中使用此包的说明。

源程序包	CNV天线_1.34.0.tar.gz
Windows二进制	CNV电池_1.34.0.zip
macOS二进制（x86_64）	CNV电池_1.34.0.tgz
macOS二进制（arm64）	CNV电池_1.34.0.tgz
源码库信息	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/CNVPanelizer网站
源存储库（开发人员访问）	git克隆git@git.bioconductor.org：包装/CNV面板
Bioc软件包浏览器	https://code.bioconductor.org/browse/CNVPanelizer网址/
包短Url	https://bioconductor.org/packages/CNVPanelizer网站/
软件包下载报告	下载统计信息