CEMi工具
协同表达模块识别工具
生物导体版本：释放（3.18）
CEMiTool软件包以全自动的方式统一了共表达基因模块的发现和分析，同时提供了具有高质量图形的用户友好html报告。我们的工具评估模块是否包含由特定路径过度表达的基因或在特定样本组中发生改变的基因。此外，CEMiTool能够将转录组数据与交互组信息集成，识别每个网络上的潜在中心。
作者：佩德罗·鲁索[aut]、古斯塔沃·费雷拉[aut][、马修斯·比格尔[aut'、卢卡斯·卡多佐[aut4]、戴奥奇斯·利马[aut]、蒂亚戈·平田[aut）、梅丽莎·利弗[autneneneea、海尔德·中谷[aut，cre]
维护人员：Helder Nakaya<hnakaya在usp.br>
安装
要安装此软件包，请启动R（版本“4.3”）并输入：
如果（！require（“BiocManager”，悄悄地=TRUE））install.软件包（“BiocManager”）BiocManager:：安装（“CEMiTool”）
对于R的旧版本，请参阅相应的生物导体释放.
文档
要查看系统中安装的此软件包版本的文档，请启动R并输入：
浏览幻影（“CEMiTool”）
细节
| 生物视图 |
基因表达式,图形和网络,免疫肿瘤学,网络,网络丰富,路径,RNA序列,软件,转录组学,mRNA微阵列 |
| 版本 |
1.26.1 |
| 在生物导体中 |
生物技术3.6（R-3.4）（6.5年） |
| 许可证 |
GPL-3公司 |
| 取决于 |
R（>=4.0） |
| 进口 |
方法、量表、dplyr、数据表（>=1.9.4）、WGCNA、网格、ggplot2、ggpmisc、ggthemes、ggreset、sna、，clusterProfiler（群集探查器）,fgsea公司，stringr，knitr，rmarkdown，igraph，DT，htmltools，pracma，integraph，grDevices，utils，network，matrixStats，ggdendro，gridExtra，gtable，快速集群 |
| 系统要求 |
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| 统一资源定位地址 |
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| 建议 |
测试，Bioc经理 |
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生成报告 |
程序包档案
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