BDMMA修正
不同队列宏基因组读取计数数据的Meta分析
生物导体版本:释放(3.18)
元基因组测序技术使微生物组的定量分析成为可能。然而,由于实验之间的差异,将这些实验中的微生物数据结合起来具有挑战性。现有的批量效应校正方法没有考虑微生物研究中变量-微生物类群-和微生物组数据过度分散之间的相互作用。因此,它们不适用于微生物组数据。我们开发了一种新的方法,贝叶斯-狄里克勒多元回归元分析(BDMMA),用于同时建模批处理效应并检测与表型相关的微生物分类群。BDMMA自动对微生物类群之间的依赖性进行建模,并对微生物组的高维度及其关联稀疏性具有鲁棒性。
作者:郑伟戴(ZHENWEI DAI)<daizwhao at gmail.com>
维护人员:郑伟戴(ZHENWEI DAI)<daizwhao at gmail.com>
引文(从R中输入引文(“BDMMAcorrect”)
):
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如果(!require(“BiocManager”,悄悄地=TRUE))install.packages(“BiocManager”)BiocManager::安装(“BDMMA修正”)
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