浅水炮舰
基于高通量DNA甲基化数据的植物表观突变率和谱的计算推断
生物导体版本：释放（3.18）
AlphaBeta是一种计算方法，用于从植物高通量DNA甲基化数据中估计表突变率和光谱。该方法专门设计用于：1。分析多代突变积累系（MA-line）背景下的“生殖系”表突变。2.分析植物发育和衰老背景下的“体细胞”表突变。
作者：Yadollah Shahryary Dizaji[cre，aut]，Frank Johannes[aut]
维护人员：Yadollah Shahryary Dizaji<Shahryary at gmail.com>
引文（从R中输入引文（“AlphaBeta”）):
安装
要安装此软件包，请启动R（版本“4.3”）并输入：
如果（！require（“BiocManager”，悄悄地=TRUE））install.软件包（“BiocManager”）BiocManager:：安装（“AlphaBeta”）
对于R的旧版本，请参阅相应的生物导体释放.
文档
要查看系统中安装的此软件包版本的文档，请启动R并输入：
浏览幻影（“AlphaBeta”）
细节
| 生物视图 |
表观遗传学,功能基因组学,遗传学,数学生物学,软件 |
| 版本 |
1.16.0 |
| 在生物导体中 |
生物技术3.10（R-3.6）（4.5年） |
| 许可证 |
GPL-3公司 |
| 取决于 |
R（>=3.6.0） |
| 进口 |
dplyr（>=0.7），data.table（>=1.10），stringr（>=1.3），utils（>=3.6.0），gtools（>=3.8.0），optimx（>=2018-7.10），expm（>=0.999-4），stats（>=3.6），生物并行（>=1.18），图表（>=1.2.4），图形（>=3.6），ggplot2（>=3.2），grDevices（>=3.5），plotly（>=4.9） |
| 系统要求 |
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| 统一资源定位地址 |
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查看更多
| 建议 |
knitr、rmarkdown |
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生成报告 |
程序包档案
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