主要功能和细节
重组生产(无动物),实现高批次一致性和长期供应安全 CTCF-ChIP级兔单克隆抗体[EPR18253] 适用于:ChIP排序、IHC-P、ChIP、ICC/IF、WB、ChIC/CUT和RUN-seq 反应对象:小鼠、大鼠、人类
相关共轭物和制剂
概述
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产品名称 -
描述 兔单克隆抗体 [EPR18253]至CTCF-ChIP等级 -
宿主 兔子 -
经测试应用 -
种属反应性 与反应: 老鼠、老鼠、人 -
免疫原 合成肽。 此信息为Abcam和/或其供应商专有。 -
阳性对照 WB:HeLa,LLC、RAW 264.7、HEK-293、HepG2、MCF7、C6、PC-12和NIH/3T3全细胞裂解物; 人胎脑、胎心、胎肾和胎脾裂解物; 小鼠脑、心、肾和脾的裂解物; 大鼠大脑、心脏、肾脏和脾脏溶解物。 IHC-P:人子宫内膜、小鼠肝脏和大鼠胃组织。 ICC/IF:HeLa和NIH/3T3细胞。 ChIP:由HeLa细胞制备的染色质。 ChIP-seq:由Hela和小鼠胚胎成纤维细胞制备的染色质。 ChIC/CUT&RUN序列:HeLa和F9细胞。
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常规说明
性能
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形式 液体 -
存放说明 在4°C下装运。 短期储存在+4°C下(1-2周)。 交付时,等分。 长期储存于-20°C。 避免冷冻/解冻循环。 -
存储溶液 pH值:7.2 防腐剂:0.01%叠氮化钠 成分:59%PBS、0.05%BSA、40%甘油(甘油、甘油) -
正在加载浓度信息。。。 -
纯度 蛋白质A纯化 -
克隆 单克隆 -
克隆编号 EPR18253 -
同种型 免疫球蛋白G -
研究领域
相关产品
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替代版本 -
ChIP相关产品 -
兼容的辅助设备 -
同位素控制 -
重组蛋白 -
相关产品
应用
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靶标
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功能 与DNA序列特异位点结合的染色质结合因子。 通过与染色质绝缘体结合参与转录调控,并防止启动子与附近的增强子和消音器之间的相互作用。 作为与脊椎动物MYC基因和BAG1基因启动子结合的转录阻遏物。 也与PLK和PIM1启动子结合。 作为APP的转录激活物。 调节APOA1/C3/A4/A5基因簇并控制MHC II类基因表达。 通过激活或抑制转录在卵母细胞和植入前胚胎发育中发挥重要作用。 似乎起到了抑癌作用。 在表观遗传调控中起关键作用。 参与印迹IGF2/H19基因位点的等位基因特异性基因表达。 在母体等位基因上,H19印迹控制区(ICR)内的结合介导母体遗传的高阶染色质构象,以限制增强子进入IGF2。 在基因组中长距离的基因沉默中起着关键作用。 优先与非甲基化DNA相互作用,防止CpG甲基化扩散并保持甲基化自由区。 相反,CpG甲基化阻止了与靶位点的结合。 在染色质重塑中起重要作用。 当它与不同的DNA序列结合时可以二聚,介导长距离染色质环。 介导IGF2/H19和WSB1/NF1之间的染色体间关联,并可能将遥远的DNA片段导向一个共同的转录工厂。 导致组蛋白乙酰化的局部损失和β-珠蛋白位点组蛋白甲基化的增加,而不影响转录。 当与染色质结合时,它为核小体定位提供了一个锚定点。 似乎对同源X染色体配对至关重要。可能与Tsix一起建立X染色体失活的可调节表观遗传开关。 可能在阻止X失活逃逸基因稳定甲基化的传播中起作用。 涉及姐妹染色单体的凝聚力。 中期与着丝粒和染色体臂相关,需要凝集素定位到CTCF位点。 调节IGF2/H19的异步复制。 -
组织特异性 无处不在的。 初级精母细胞中缺失。 -
序列相似性 属于CTCF锌指蛋白家族。 包含11个C2H2型锌指。 -
结构域 11个锌指在脊椎动物中高度保守,显示出几乎相同的氨基酸序列。 不同的锌指亚群或组合使CTCF能够识别多个DNA靶点。 -
翻译后修饰 Lys-74和Lys-689上的Sumoylated; CTCF的sumoylation有助于CTCF对MYC P2启动子的抑制功能。 -
细胞定位 细胞核>核质。 染色体。 染色体>着丝粒。 可能在细胞分化时易位到核仁。 中期与着丝粒和染色体臂相关。 与有丝分裂染色体中的H19 ICR相关。 在间期可能优先排除异染色质。 -
UniProt提供的信息 -
数据库链接 Entrez基因: 10664 人类 Entrez基因: 13018 鼠标 Entrez基因: 83726 老鼠 Omim公司: 604167 人类 瑞士保护银行: 第49711页 人类 瑞士保护银行: Q61164问题 鼠标 瑞士保护银行: 问题9R1D1 老鼠 尤尼金: 368367 人类
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别名 11锌指蛋白抗体 11锌指转录阻遏物抗体 11-锌指蛋白抗体
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图片
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染色质由小鼠胚胎成纤维细胞制备。 细胞用1%甲醛固定10分钟。 用10^7个细胞和8µg[抗CTCF抗体](ab188408)进行ChIP。 ChIP DNA在Illumina NovaSeq 6000上测序,深度为3000万读。 还显示了输入控件。 可以下载映射读取的其他屏幕截图 在这里 . -
使用最终浓度为700 ng/mL的pAG-MNA酶、2 x 10^5 HeLa(人宫颈腺癌上皮细胞系)细胞和5µg ab188408[EPR18253]进行ChIC/CUT&RUN。 所得DNA在Illumina NovaSeq 6000上测序,测序深度为1000万读。 阴性IgG对照 约172730 图中还显示了。 ChIP数据是在HeLa细胞制备的染色质上进行的。 细胞用1%甲醛固定10分钟。 使用10^7 HeLa细胞和8µg ab188408进行ChIP。 ChIP DNA在Illumina NovaSeq 6000上进行测序,深度为3000万次。 可以下载映射读取的其他屏幕截图 在这里 . 日内瓦大学拥有与ChIC(染色质免疫清洗)方法相关的专利。 -
从HeLa细胞制备染色质。 细胞用1%甲醛固定10分钟。 使用30µg染色质和4µg抗-CTCF抗体[EPR18253]-ChIP级(ab188408)进行ChIP。 ChIP DNA在Illumina NextSeq 500上测序,深度为3000万读。 ChIP-Seq验证由加利福尼亚州卡尔斯巴德的Active Motif执行。 可以下载映射读取的其他屏幕截图 在这里 . -
根据Abcam X-ChIP协议,从HeLa(宫颈腺癌人上皮细胞)细胞制备染色质。 用甲醛固定细胞10分钟。 使用25µg染色质、2µg ab188408(蓝色)和20µl抗兔IgG sepharose珠进行ChIP。 将2μg兔正常IgG添加到珠子对照品中(黄色)。 免疫沉淀DNA通过实时PCR(Sybr green方法)定量。 -
所有车道: 抗-CTCF抗体[EPR18253]-ChIP等级(ab188408),1/5000稀释 车道1: HeLa(人宫颈腺癌上皮细胞)全细胞裂解物 车道2: LLC(小鼠肺癌)全细胞裂解物 3号车道: RAW 264.7(用Abelson小鼠白血病病毒转化的小鼠巨噬细胞)全细胞裂解物 车道4: HEK-293(人胚胎肾上皮细胞)全细胞裂解物 车道5: HepG2(人肝癌)全细胞裂解物 车道6: MCF7(人乳腺癌细胞系)全细胞裂解物 每车道20µg的裂解液/蛋白质。 次要 所有车道: 山羊抗狂犬病IgG H&L(HRP)( ab97051型 )稀释度为1/100000 预测的带宽大小: 83,46千Da 暴露时间: 1秒 阻塞/稀释缓冲液:5%NFDM/TBST。 观测MW:140、97、80、73、70、55 kDa。 在WB中观察到的倍数带已在文献中报道(PMID:12878173,PMID:8246978)。 -
所有车道: 抗-CTCF抗体[EPR18253]-ChIP等级(ab188408),稀释度为1/1000 车道1: C6(大鼠胶质瘤细胞)全细胞裂解物 车道2: PC-12(大鼠肾上腺嗜铬细胞瘤)全细胞裂解物 3号车道: NIH/3T3(小鼠胚胎成纤维细胞)全细胞裂解物 每条泳道10µg的裂解物/蛋白质。 次要 所有车道: 山羊抗狂犬病IgG H&L(HRP)( ab97051型 )稀释度为1/100000 预测的带宽大小: 83,46千Da 暴露时间: 1秒 阻塞/稀释缓冲液:5%NFDM/TBST。 观测MW:140、130、97、80、73、70、55 kDa。 文献报道了WB中观察到的多条带(PMID:12878173,PMID:8246978)。 -
所有车道: 抗-CTCF抗体[EPR18253]-ChIP等级(ab188408),稀释度为1/1000 车道1: 人胎脑裂解物 车道2: 人胎心裂解物 3号车道: 人胎肾裂解物 车道4: 人胎脾裂解物 每条泳道10µg的裂解物/蛋白质。 次要 所有车道: 抗狂犬病IgG(HRP),针对1/100000稀释度的非还原型IgG 预测的带宽大小: 83,46 kDa 暴露时间: 15秒 阻塞/稀释缓冲液:5%NFDM/TBST。 观测MW:140、130、97、80、73、70、55 kDa。 文献报道了WB中观察到的多条带(PMID:12878173,PMID:8246978)。 -
所有车道: 抗-CTCF抗体[EPR18253]-ChIP等级(ab188408),稀释度为1/1000 车道1: 小鼠脑裂解物 车道2: 小鼠心脏裂解物 3号车道: 小鼠肾裂解物 车道4: 小鼠脾裂解物 每条泳道10µg的裂解物/蛋白质。 次要 所有车道: 山羊抗狂犬病IgG H&L(HRP)( ab97051型 )稀释度为1/100000 预测的带宽大小: 83,46千Da 暴露时间: 15秒 阻塞/稀释缓冲液:5%NFDM/TBST。 观测MW:140、130、97、80、73、70、55 kDa。 文献报道了WB中观察到的多条带(PMID:12878173,PMID:8246978)。 -
所有车道: 抗-CTCF抗体[EPR18253]-ChIP等级(ab188408),稀释度为1/1000 车道1: 大鼠脑裂解物 车道2: 大鼠心脏裂解物 3号车道: 大鼠肾裂解物 车道4: 大鼠脾裂解物 每条泳道10µg的裂解物/蛋白质。 次要 所有车道: 山羊抗狂犬病IgG H&L(HRP)( ab97051型 )稀释度为1/100000 预测的带宽大小: 83、46千Da 暴露时间: 2秒 阻塞/稀释缓冲液:5%NFDM/TBST。 观察到的MW 140、130、97、80、73、70、55kDa。 文献报道了WB中观察到的多条带(PMID:12878173,PMID:8246978)。 -
4%对甲醛固定、0.1%Triton X-100透性HeLa(宫颈腺癌人上皮细胞)细胞的免疫荧光分析,在1/2000稀释度下用ab188408标记CTCF,然后用山羊抗Rabbit IgG(Alexa Fluor ® 488) ( 约150077 )稀释度为1/1000的二级抗体(绿色)。 共聚焦图像显示HeLa细胞系上的核染色。 核反染为DAPI(蓝色)。 用抗阿尔法Tubulin小鼠单克隆抗体检测Tubulin( 约7291 )稀释1/1000,然后使用山羊抗鼠IgG H&L(Alexa Fluor ® 594) ( ab150120型 )稀释度为1/1000的二级抗体(红色)。 阴性对照如下: -ve对照1:ab188408,1/2000稀释,然后是山羊抗鼠IgG H&L(Alexa Fluor ® 594) ( ab150120型 )二级抗体的稀释度为1/1000。 -ve控制2: 约7291 抗α-Tubulin小鼠MAb( 约7291 )稀释1/1000,然后用山羊抗狂犬病IgG H&L(Alexa Fluor ® 488) ( 约150077 )二级抗体的稀释度为1/1000。 -
4%对甲醛固定、0.1%Triton X-100透性NIH/3T3(小鼠ebyronic成纤维细胞)细胞的免疫荧光分析,在1/2000稀释度下用ab188408标记CTCF,然后用山羊抗狂犬病IgG H&L(Alexa Fluor ® 488) ( 约150077 )稀释度为1/1000的二级抗体(绿色)。 共聚焦图像显示NIH/3T3细胞系上的核染色。 核反染为DAPI(蓝色)。 用抗阿尔法Tubulin小鼠单克隆抗体检测Tubulin( 约7291 )稀释1/1000,然后使用山羊抗鼠IgG H&L(Alexa Fluor ® 594) ( ab150120型 )第二天抗体的稀释度为1/1000(红色)。 阴性对照如下: -ve对照1:ab188408,1/2000稀释,然后是山羊抗鼠IgG H&L(Alexa Fluor ® 594) ( ab150120型 )二级抗体的稀释度为1/1000。 -ve对照2:抗阿尔法Tubulin小鼠MAb( 约7291 )稀释1/1000,然后使用山羊抗狂犬病IgG H&L(Alexa Fluor ® 488) ( 约150077 )二级抗体的稀释度为1/1000。 -
使用200000 Oli-neu(少突胶质细胞祖细胞)细胞进行CUT和Tag-seq。 用0.05%的洋地黄素和0.01%的NP-40使细胞渗透3分钟。 使用1:100稀释的重组抗CTCF抗体[EPR18253]-ChIP级(ab188408),以及豚鼠抗兔二级抗体。 使用Illumina NovaSeq S Prime对DNA进行分段,深度为2400万读。 这张图片由Gonçalo Castelo-Branco Group的Marek Bartosovic博士提供 , 卡罗林斯卡学院 . 日内瓦大学拥有与ChIC(染色质免疫清洗)方法相关的专利。
数据表及文件
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合格证书
文献 (8)
凯亚尔B 等。 通过lncRNA Mrhl介导的染色质环调控小鼠精原细胞中的Sox8。 分子细胞生物学 42:e0047521(2022)。 公共医学:35412350 肖Y 等。 前瞻性队列研究中驾驶员和乘客DNA甲基化对膀胱癌的非侵入性诊断和监测。 临床翻译医学 12:e1008(2022)。 公共医学:35968916 Azambuja AP&Simoes-Costa M公司 神经嵴增强子的连接体揭示了信号系统的调节特征。 开发人员单元格 56:1268-1282.e6(2021)。 公共医学:33852891 侯毅 等。 CTCF通过POLD1介导复制衰老。 前电池开发生物 9:618586 (2021). 公共医学:33692996 奥尔布利希T 等。 CTCF是2C类重新编程的障碍。 国家公社 12:4856(2021)。 公共医学:34381034 汉达T 等。 染色质整合标记用于绘制DNA结合蛋白和低输入修饰。 Nat协议 15:3334-3360 (2020). 公共医学:32807906 梅S 等。 拓扑关联域边界上的功能变体与胰腺癌风险相关。 摩尔癌 58:1855-1862 (2019). 公共医学:31237042 赵X 等。 风险相关长非编码RNA FOXD3-AS1通过抑制PARP1介导的CTCF激活抑制神经母细胞瘤进展。 分子治疗 26:755-773 (2018). 公共医学:29398485