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干扰素调节因子		 交换偿付费
SMART登录号：SM00348型
描述： 干扰素调节因子，也称为trytophan pentad repeat
解释摘要(IPR001346):

病毒感染诱导I型干扰素（IFN-α和IFN-β）基因的表达。诱导是由于IFN基因的转录激活。干扰素调节因子I（IRF-1）是负责这种激活的转录因子之一。IRF-1结合上游调控顺式元件，称为干扰素一致序列（ICS），该序列存在于I型干扰素和干扰素诱导的MHC I类基因的启动子中。干扰素调节因子2（IRF-2）是一种也与ICS相互作用的蛋白质，但不起激活剂的作用；相反，它在某些情况下抑制IRF-1的功能[(出版时间：2691585) ].

这些蛋白质共享约100个氨基酸残基的高度保守的N末端结构域，这些氨基酸残基参与DNA结合，并含有五种保守的色氨酸。该结构域被称为“色氨酸五肽重复序列”或“色氨酸簇”，也存在于：

  • 干扰素一致序列结合蛋白（ICSBP）[(出版日期：2111015)]，一种主要在淋巴组织中表达的转录因子，由IFN-γ诱导，也与ICS结合。
  • 转录调节因子ISGF3γ亚基[(出版日期：1630447) ]. ISGF3负责最初刺激干扰素α应答基因。它识别并结合目标基因调控序列中的干扰素刺激反应元件（ISRE）。
  • 干扰素调节因子3（IRF-3）。
  • 干扰素调节因子4（IRF-4），与MHC I类启动子的干扰素刺激反应元件（ISRE）结合。
  • 干扰素调节因子5（IRF-5）。
  • 干扰素调节因子6（IRF-6）。
  • 干扰素调节因子7（IRF-7）。
  • γ疱疹病毒vIRF-1、-2和-3，与IRF家族细胞转录因子同源的蛋白质(出版日期：10933732) ]. vIRF-1和vIRF-2与DNA的结合都没有与细胞IRF具有相同的特异性，这表明如果vIRF是DNA结合蛋白，那么它们的结合模式与细胞IRFs不同。vIRF-3是否能以与细胞IRF相同的特异性结合DNA尚不清楚。

IRF色氨酸五重复DNA结合域具有α/β结构，包括三个α-螺旋簇（α1-alpha3），其一侧由混合四链β-片（β1-beta4）构成。它形成一个螺旋-转螺旋基序，与目标启动子中发现的ISRE一致序列结合。三个色氨酸残基通过识别GAAA序列与DNA接触[(出版日期：9422515) ].

此条目表示IRF色氨酸五重复DNA A结合域。

GO功能：转录调控区序列特异性DNA结合(GO:0000976号)
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有39783974种蛋白质中的IRF结构域SMART的nrdb数据库。

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