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Calponin同源结构域
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SMART登录号:SM00033型
描述: 肌动蛋白结合域在蛋白样蛋白(包括肌营养不良蛋白、α-肌动蛋白)的N末端重复出现。这些结构域将肌动蛋白丝交联成束和网络。在酵母Cdc24p中预测了钙调素同源结构域。
解释摘要(知识产权001715):

许多肌动蛋白结合蛋白,包括精蛋白、α-肌动蛋白和伞蛋白,包含一个250个氨基酸的延伸,称为肌动蛋白绑定域(ABD)。ABD可能是由一个结构域的复制引起的,该结构域也存在于许多其他蛋白质(如钙调素或vav原癌基因)的单个拷贝中,被称为钙调素同源(CH)结构域[(出版日期:9708889) (出版日期:9887274) ].

对CH结构域蛋白的详细分析表明,它们可以分为三组[(出版日期:9708889) ]:

  • 含有两个ABD的单体肌动蛋白交联分子伞蛋白家族
  • 二聚交联蛋白(α-肌动蛋白、β-精蛋白、丝氨酸蛋白等)和单体F-肌动蛋白结合蛋白(肌营养不良蛋白、营养不良蛋白),每个都含有一个ABD
  • 只含有一个氨基末端CH结构域的蛋白质。

每个包含两个CH结构域的单个ABD能够结合细丝中的一个肌动蛋白单体。N末端CH结构域具有与肌动蛋白结合的内在能力,尽管其亲和力低于完全ABD,而C末端CH与肌动分子的结合极弱或根本不结合。然而,全功能ABD需要两个CH域;C末端CH结构域通过域间螺旋-螺旋相互作用对完整ABD的整体稳定性作出贡献[(出版日期:9708889) ]. 一些含有单个CH结构域的蛋白质也与肌动蛋白结合,尽管这还没有被证明是通过单个CH结构区来实现的[(出版日期:9887274) ]. 此外,CH结构域也存在于一些未知的结合肌动蛋白的蛋白质中,一个显著的例子是vav原癌基因。

不同CH域的3D结构的分辨率表明,保守核由四个主要的α-螺旋组成[(出版日期:9887274)]。

含有钙调素结构域的蛋白质包括:

  • Calponin,参与调节平滑肌细胞中肌动蛋白细胞骨架的收缩性和组织(出版日期:11839310) ].
  • β-精蛋白,连接肌动蛋白丝和完整的质膜蛋白的膜下细胞骨架网络的主要成分[(出版日期:17121810) ].
  • 肌动蛋白纤维束或交联蛋白的伞蛋白/质体蛋白家族的肌动蛋白交联域[(出版日期:9302997) ].
  • Utrophin,与肌营养不良蛋白[(出版日期:9887274)]。
  • 肌营养不良蛋白,在杜氏肌营养不良症中发现有缺陷的蛋白质;该蛋白包含两个CH结构域的串联重复序列[(出版日期:10801490) ].
  • 一种广泛表达的细胞连接蛋白——plectin的肌动蛋白结合域(出版日期:15128297) ].
  • 微管相关蛋白eb1(末端结合蛋白)的N末端微管结合域,该蛋白是一个保守蛋白家族的成员,定位于微管的脉冲端[(出版日期:12857735) ].
  • Ras GTPase活化样蛋白rng2,一种IQGAP蛋白,在胞质分裂期间对肌动球蛋白环的组装至关重要(出版日期:15272162)]。
  • 转基因,抑制雄激素受体反式激活[(出版日期:17082327) ].
GO功能:蛋白质结合(去:0005515)
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6672845684个蛋白中的CH结构域SMART的nrdb数据库。

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