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为Kurihara,K找到42条引文。

搜索Kurihara,K。世界结晶学家名录

结果1到20,按名称排序:


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中子晶体学可以提供大量关于蛋白质水合作用的信息。三种蛋白质的水合模式显示出有趣的特征,其结构已使用我们的BIX型衍射仪以1.5或1.6°的分辨率进行了解析。水分子在中子傅里叶图中采用了多种形状,揭示了分子间氢键形成和水合动力学的细节。此外,简要介绍了一种DNA结合蛋白——异化亚硫酸盐还原酶D(DsrD)的中子衍射研究,并给出了一些初步结果。这个话题很有趣,因为众所周知氢键在DNA蛋白质识别中起着重要作用。

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单晶中子衍射研究在1.6嗜热弓形体中一个突变的红细胞氧化还原蛋白的光学解析暴躁P.furiosus.

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《水晶学报》。(2008).一个64C564至C565
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将价层电子和氢原子的信息纳入晶体结构精细化对理解电子转移反应非常重要。高电位铁硫蛋白(HiPIP)具有一个Fe4S4簇,表现出+2/+3氧化还原态,作为细胞色素bc1络合物到光合紫色细菌反应中心络合物的电子载体。最近,我们在SPring-8的BL41XU光束线中使用高能X射线(31 keV)成功收集到了0.48º分辨率的HiPIP数据。我们使用MoPro程序(2)进行多极细化,以在HiPIP的结构细化中考虑价层电子。多极参数的精细化应用于单构象残基原子、含两个氢原子的水分子和Fe4S4团簇。经过多极细化后,变形图清楚地显示了价层电子的分布,例如羰基氧原子的孤对电子、芳香环中的键电子和Fe4S4团簇中Fe原子的d轨道电子。变形图还显示了Fe4S4-(Cys-Sγ)4的S原子与蛋白质环境之间的静电相互作用。此外,我们在日本质子加速器研究中心(J-PARC)的iBIX光束线上进行了初步中子衍射实验,并使用尺寸为2.3 mm3的HiPIP晶体观察到高达1.17º分辨率的衍射点。在多极精细化中,氢原子的位置被固定在由小分子中子晶体结构导出的标准键距离上,氢原子原子的原子位移参数被限制在其根原子的1.2或1.5倍。因此,HiPIP的高分辨率中子结构将改善多极精细化的结果。

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采用冷气流冷却和液氮预冷两种方法对中子衍射实验用大晶体进行厌氧冷却,比较了它们对晶体质量的影响。气流冷却足以抑制整个晶体镶嵌性的增加,从而成功地从普通脱硫弧菌以其有效的简化形式。

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胰岛素T核心的电荷平衡和氢键网络6用中子衍射分析法对六聚体进行了2.1º分辨率的研究。

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利用X射线和中子数据对胰蛋白酶-牛胰蛋白酶抑制剂(BPTI)复合物的晶体结构进行了精细化。在胰蛋白酶-BPTI复合物中观察到催化三元质子化状态和剪刀肽键P1′Ala16的酰胺H原子的H/D交换。

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《水晶学报》。(2011).一个67C730-C731型
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为了研究与猪胰腺弹性蛋白酶(PPE)结合的共价抑制剂的结构特征,包括H原子和水的水合作用,将猪胰腺弹弹性蛋白酶及其抑制剂晶体生长到1.6 mm用于中子衍射研究。由于氘和碳的原子散射特性相似,晶体衍射到2.3º分辨率,质量足以用于进一步的结构测定。

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《水晶学报》。(2010).一个66第126-s127节
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设计了一种新的衍射仪,可以测量大晶格常数的膜蛋白和蛋白质复合物晶体。模拟研究证实了晶格长度为250的峰分离能力沿着每个轴的d日最小值= 2.0以及令人满意的辐射安全水平。

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中子蛋白质晶体学获得的氢原子和水合水的结构信息有望有助于阐明蛋白质的功能及其改进。然而,许多蛋白质,尤其是膜蛋白和蛋白质复合体,分子量较大,因此其晶体的单位细胞体积较大,这超出了传统衍射仪的可测量单位细胞体积范围。因此,我们的团队设计了衍射仪,可以覆盖具有大晶胞体积(目标晶格长度:250Å)的晶体。该衍射仪专用于蛋白质单晶,建议安装在J-PARC(日本质子加速器研究中心)。更大的单元体积会导致衍射图像中在空间和时间维度上分离距离更近的斑点。因此,我们提出的衍射仪采用较长的相机距离(L2=800mm),并选择去耦氢慢化剂作为脉冲宽度较短的中子源。在L1为33.5m的条件下,光束发散0.40晶体边缘尺寸为2mm,估计该衍射仪能够分辨出晶格长度为220°的晶体在d空间为2.0°时在每个轴上衍射出的斑点。为了覆盖由于相机距离较长而导致的较大中子探测区域,正在开发空间分辨率高于2.5mm的新型大面积探测器(大于300mm×300mm)。计划安装40多个此类探测器,提供大于33%的总立体角覆盖率。对于中子导管,考虑采用椭球超镜来增加样品位置的中子通量。与日本原子能机构研究堆JRR-3中运行的BIX-3/4衍射仪相比,该衍射仪的最终增益因子估计约为20或更大[1,2]。

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在JAERI JRR-3M的1G-B端口建造了一台新的中子单晶衍射仪(BIX-4)。由于在1G-B接口处另一台生物衍射仪BIX-3和一台高分辨率粉末衍射仪(HRPD)共存,因此需要对单色仪室进行改造。BIX-4的主要架构基于BIX-3的架构。BIX-4使用弹性完美Si晶体单色器和中子成像板作为BIX-3。此外,还对单色器进行了一些优化,并对之前的BIX-3进行了改进。探测器位置处中子强度的最终增益估计为之前BIX-3的2.5倍。这种更高的性能增加了将中子结晶学应用于生物大分子的机会,因为生物大分子只能产生微弱的反射和/或小晶体。

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《水晶学报》。(2005).一个61c411号机组
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通过中子衍射测定了药物靶蛋白,如人类免疫缺陷病毒蛋白酶和胰腺弹性蛋白酶与过渡态类似物抑制剂的复合物的晶体结构。

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《水晶学报》。(2005).一个61c481号机组
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新一代中子源J-PARC上的飞行时间中子单晶衍射仪iBIX已经升级,可用于蛋白质样品的用户实验。为了评估iBIX的性能,对标准蛋白质样品进行了中子结构分析。

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