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Furey,W.共被引用31次。

搜索W.福雷。世界结晶学家名录

结果1到20,按名称排序:


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《水晶学报》。(2005年)。一个61c202号
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同二聚体E1脱辅基酶结构的首次报道表明,与异源四聚体支链特异性酶相比,没有证据表明与全酶相关的无序-有序环转换。在活性位点区域,组氨酸残基His142清楚地显示出在脱辅酶中部分占据了两个不同的旋转体位点,有序溶剂分子的数量从脱辅酶增加到全酶再到抑制剂复合物。

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《水晶学报》。(1984).一个40C11号机组
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丙酮酸脱氢酶多酶复合物(PDHc)是一种大型大分子机器,可将糖酵解产物丙酮酸转化为乙酰辅酶a,整个PDHc反应是碳水化合物代谢的控制点。PDHc水平的改变与包括阿尔茨海默病(Alzheimers)和帕金森病(Parkinson)在内的神经系统疾病有关,由于其在糖代谢中的作用,其调节机制是控制2型糖尿病的靶点。抑制PDHc的组织特异性、调节性激酶会增加活性氧物种的线粒体水平,从而导致细胞凋亡和抑制肿瘤生长,这表明有治疗癌症的潜力。发现了两种主要类型的复合物:约4.5兆道尔顿,八面体复合物,包含60个酶亚基,具有立方核;和包含约120个酶亚基的约9个巨核二十面体复合物,具有十二面体核心。至少3种关键酶组分E1、E2和E3的多个拷贝始终存在,而较大的复合物也可能包含调节性磷酸酶、激酶和非酶类E2蛋白。配合物所采用的组装和不寻常的底物通道机制非常吸引人,因为中间体通过一个长的、高度灵活的“摇臂”手递送系统在活性位点之间转移,该系统采用脂酰结构域,而不是简单的扩散。我们对大肠杆菌中PDHc的酶组分及其一些二元亚复合物进行了晶体学分析。我们发现:对于含有同二聚体和异四聚体E1组分的配合物,稳定整体组装的关键E1-E2相互作用存在显著差异(位移超过100埃!);同二聚体E1的部分构象在其E2结合伙伴的存在下显著稳定,并显示出新的折叠;基于二十面体配合物的八面体PDHc配合物模型可能不正确。

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单一同构替换(SIR)数据的直接方法程序【Hauptman(1982)】。《水晶学报》。一个38,289-294],由Fortier,Moore&Fraser修改[《水晶学报》(1985),A41,571-577]已经用大量已知结构实现和测试。发现修改后的程序大大减少了与0或π,但不会完全删除它。如果重原子不在中心对称阵列中,则不变估计的分布重心不以真实蛋白质值为中心,而是偏向传统SIR值达15°,因此估计中的误差不是随机的,而是系统的。当重原子位于中心对称阵列(或空间群中的单个重原子位置)中时P(P)21)估计值的分布通常是急剧的双峰分布,峰值集中在真实不变值和纯“未解析”SIR值上。给出了简单的程序,可以在这两种情况下应用,以显著减少偏差,而不会造成整体精度损失。然后描述了一个额外的校正因子,它可以用来消除几乎所有的偏差,并提高精度。结果是,校正不变估计中的误差幅度很小,但现在也是随机的,而不是系统的。由于估计数大大超过了阶段数,剩余的随机误差对阶段化过程的影响应该很小。

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《水晶学报》。(2005年)。一个61c56码
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迄今为止,已经为DEC 10计算机驱动的阵列处理器(浮点系统模型AP 190L)开发了六个计算密集但经常需要的晶体学应用程序。在所有尝试的应用程序中,可以将所需的处理时间减少到至少一个数量级,低于大型大学规模计算机(DEC 10)对同一问题的要求。事实上,全矩阵最小二乘优化中的速率确定步骤可以使阵列处理器的运行速度提高20-30倍。对于蛋白质的精细化,使用空间组通用算法的一个循环在阵列处理器中的执行速度比典型的小分子精细化循环在DEC 10上的执行速度更快。我们得出的结论是,在晶体学计算机程序中经常遇到的许多耗时的操作可以在连接到主机的廉价阵列处理器上非常有效地处理。

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描述了一种程序,利用Watson-Kendrew模型从中分辨率电子密度图(~3-4º)中获得的原始原子坐标可通过使用有限的数据子集和非交互式计算机图形细化为近原子分辨率的本地数据。Bence-Jones蛋白Rhe的精制过程包括从3.0到1.9º的相延伸,并导致蛋白质的结晶序列得到改进。通过立体化学约束最小二乘法在倒易空间中将结构细化到残值R(右)F类=0.284,对于由795个非氢蛋白质原子组成的模型,使用具有d日范围为5.0至1.9º。通过经验确定了结构因子和立体化学再应变观测的相对权重,并发现最佳权重为以下屈服值W公司|F类o个-F类c(c)|2通常是W公司|d日o个-d日|2,其中d日o个d日是立体化学约束参数的当前值和理想值。结果表明,仅用32%的观测数据就可以得到合理的细化。

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测定了不同pH值(5.0–8.0)下葡萄球菌肠毒素C2的晶体结构,以研究pH值对结合锌的影响。

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本文的重点是基于网格版本的SnB公司BnP公司,基于的程序摇晃和烘焙根据X射线衍射数据确定分子结构的方法。

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《水晶学报》。(1981).一个3777国集团
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