搜索

可以通过在文本字段中输入关键字（如“ATP liver”）来执行自由文本搜索。这将检索包含搜索词的所有条目（如果只出现在出版物标题中，也会检索）。
可以使用“高级搜索”选项卡执行更复杂的搜索。了解更多信息


      
高级搜索

  • 以自由文本形式输入搜索词（如谷歌）
  • 按“放大镜”开始搜索
  • 搜索结果将显示在下面（向下滚动↓)
  • 选择条目（标记复选框）
  • 如果要导出数据，请单击每个条目的复选框，最后单击右上角的符号以继续

输入数据概述(转到帮助/信息 视频图尔)
Overview中的一行表示数据库中的一个条目。
单击键/轴名称以按该键排序。将鼠标悬停在热图上以查看数据值。
通过单击热图区域选择值。多个类别或范围由选择疾驰的.
可在中设置可见轴/键概述'可见概览轴'（单击以打开/关闭）
可以使用重置所有图形上的选择“重置突出显示”。
所选配色方案（在中设置'配色方案（PC、SPM、KPPC、KPSP）')以下为：等离子（暖色、深色）
  

*键/轴从整个颜色方案中进行适当选择（按该键排序时可以看到颜色图例），例如。
双值键（例如速率方程）使用配色方案的结束颜色，而唯一数字键（例如EntryID）使用整个配色方案。
*概述显示了每个键/轴的颜色（按该轴/键排序时效果最佳）。
所有其他图形（PC、SPM、KPPC、KPSP）使用一个轴/键进行着色（在'PC，SPM:按轴颜色','KPPC，KPSP:按轴颜色').
*通过在'空（“-”）值颜色（适用于所有图形）':     默认值（最小色阶）挑选出来的
突出显示的数据：

0






轴：


只允许八个（七加索引）可见PC轴，以防止混乱。

SPM完整矩阵


PC和KPPC图形的高度限制为1200px。如果图形较大，轴上可能会出现一些刻度混乱。


动力学参数数据：



外观：

配色方案
（PC、SPM、，KPPC、KPSP)


NULL（“-”）值颜色
（对于所有图形）
如果数据按包含空值的键排序，则“空”颜色可见。

PC，SPM：按轴着色

KPPC、KPSP：按轴着色


各种：
输入数据的平行坐标（PC）
正在加载图形，请稍候。。。

刷轴以选择数据（支持多选）。
详细的数字数据值可以在Overview或SPM上查看（或在Entry View选项卡中）。
PC可视轴/键可以设置在'可见PC轴（最多8个）'
按键着色的PC（设置在'PC，SPM:按轴颜色')以下为：
输入数据的散点图矩阵（SPM）（仅数值->pH值、温度、年份；分别为动力学数据）
正在加载图形，请稍候。。。

刷任意散点图以选择数据。
SPM可见轴/键可以设置在'可见SPM轴'
按键着色的SPM（设置在'PC，SPM:按轴颜色')以下为：
动力学参数
动力学参数的平行坐标（KPPC）（加上温度、pH值）（每个条目可以有多个参数）
正在加载图形，请稍候。。。


每个条目可以有多个动力学参数，可以在两个图（KPPC、KPSP）中进行探索。
刷轴以选择数据。
详细的数值数据值可以在散点图KPSP上看到（或在条目视图选项卡中）。
KPPC可见轴/键可以设置在'可见KPPC轴'
当前显示的类型（在中设置'使用的数据类型')以下为：
KPPC由键着色（设置在'KPPC，KPSP:按轴显示颜色')以下为：
KPPC、KPSP使用配色方案（在'配色方案（PC、SPM、KPPC、KPSP）')以下为：
使用KPSP查看参数详细信息。
KPPC本地缩放状态（允许通过搜索无法进行详细的参数空间探索）:
    缩小时必须重新选择参数数据类型（设置为'使用的数据类型'). 缩放时并非所有类型都可用。


搜索按钮将为您提供包含所有参数的条目。
通过缩放然后选择搜索，首先限制本地搜索。
在搜索之前不选择任何内容将给出初始结果。
动力学参数值散点图（KPSP）（加上温度、pH值）（每个条目可以有多个参数）
正在加载图形，请稍候。。。


  当前着色的点：
KPSP目前显示：起始值与
KPSP是KPPC的附加组件，用于查看参数详细信息（将鼠标悬停在点上以查看值）。
数据可以缩放和平移，但应在KPPC上选择。
显示/隐藏 视频图尔
前三个图表示数据库条目的一般信息（Overview、PC、SPM）。
由于每个条目可以包含多个动力学参数，因此可以单独探索动力学参数的数据空间（使用KPPC和KPSP）。
最后两个图提供了关于属于条目的动力学参数（KPPC、KPSP）的更多详细信息，以及通过其数据空间进行探索的选项。
搜索后会获得许多条目。

选择/突出显示其中一个图形上的数据子集。高亮显示的数据数量和使用的属性在可视化选项卡的右上角可见（所选动力学参数的数量）.
点击“将所选内容添加到搜索“在结果数据上应用所选标准（突出显示）执行搜索，从而优化搜索。例如。
如果当前搜索查询是上一个查询的细化”使用上一个查询（返回）“按钮可用于再次执行上一个查询。只能自动后退一步，但如果需要，可以手动操作查询。


可以通过以下方式操作图形和突出显示数据：
概述热量图中给出了生成数据项的数量：
*通过单击属性的标题对每列进行排序（向上、向下），按住“shift”键并拖动列以重新排列列。
*使用显示/隐藏列可见概述轴.
*通过单击突出显示各个值。
*通过画笔突出显示范围（用绿线标记的已排序列的范围）。
*刷牙时，细绿线（从粗线延伸）显示所选类别的全部范围。

平行坐标（PC）：
*通过双击轴标题对轴进行排序，通过拖动重新排列轴。
*显示/隐藏轴使用可见PC轴（除分度轴外，最多7个）。
*通过在不同轴上画笔高亮显示范围（单个轴上可能有更多范围）。
*PC图形的高度由数据决定，但有限制（有最小和最大高度）。如果图形应大于最大高度，则轴上可能会出现一些刻度混乱。
*数值轴（如pH和温度）的空值显示在直线下方，与分类轴（如UniprotID）不同，分类轴在轴上具有空值或“-”作为类别。

散点图矩阵（SPM）：
*使用显示/隐藏属性（数字属性）可见SPM轴.
*通过在其中一个散点图上画笔高亮显示范围。
*直方图显示属性值频率（分为10个箱子/列）。
*可以显示完整的SPM矩阵。
*将鼠标悬停在点上方时，可以在工具提示上看到有关点值的详细信息。
*没有值（“-”）的点显示在左侧或轴下方。
*如果只存在没有值（“-”）的点，则它们显示在相应图像底部/左侧零线的下方或左侧。
*较低的刻度值对直方图有效，而左侧的刻度（加上较低的）仅对矩阵中的散点图有效。
动力学参数平行坐标（KPPC）：
*KPPC上的EntryID轴将动力学参数与其他图形连接起来：每个参数都属于一个条目。一个条目可以有多个参数。
*通过双击轴标题对轴进行排序，通过拖动重新排列轴。
*显示/隐藏轴使用可见KPPC轴（类型和条目ID始终可见）。
*通过在不同轴上画笔高亮显示范围（单个轴上可能有单个范围）。
*通过选择选择显示的动力学参数数据类型使用的数据类型（必须至少是一个）。
*在搜索给定类型上预先选择类型：Km、Vmax、kcat默认设置（如果存在）。用户可以通过在GUI中进行选择来查看任何其他类型。
*当前选择的类型在图表下方说明。
*起始值原始轴显示参数的原始值。
*起始值日志轴是对数轴（因为显示值的原始范围可能很大）。原始范围可见于笔刷信息动力学参数PC.
*可以使用放大/缩小按钮。
*一旦缩小了所需的值（并在KPPC上选择），就可以使用“将所选内容添加到搜索“按钮。
*动力学参数搜索查询使用所选关键字（如果可用），例如ParameterType、AssociatedSpecies。
*在没有可用关键字的情况下，动力学参数搜索查询使用entryID。
*搜索结果给出完整条目（意味着结果参数数据大于选择）。
*KPPC图的高度由数据决定，但有限制（有最小和最大高度）。如果图形应大于最大高度，则轴上可能会出现一些刻度混乱。
*为了方便起见，KPPC还可以显示温度和pH值，轴也可以用这些值着色。
*数值轴（例如pH和温度）的空值显示在直线下方，而分类轴的空值或轴上的类别为“-”。

动力学参数值散点图（KPSP）：
*散点图显示了“原始起始值”与“温度”、“pH”或“入口ID”的值。
*用户可以使用图形上方的下拉菜单（“温度”、“pH”或“条目ID”）选择y轴上的值。
*用户可以使用图形上方的下拉菜单（“均匀”、“温度”、“pH”或“条目ID”）选择用于点大小的轴。点大小在设定范围（大小5到10）之间进行插值。使用范围滑块可以设置更大的范围[1,30]。统一大小为5（无范围滑块）。
*用户可以使用“使用的数据类型”选择GUI中显示值的动力学参数类型（图形会相应更新）。
*可以使用计算机鼠标或触摸板缩放和平移图形。
*按重置位置按钮（缩放值显示在按钮上方）。
*当鼠标悬停在点上方时，可以在工具提示中查看有关点值的详细信息。
*轴下方显示无值（“-”）的点。
*如果只存在没有值（“-”）的点，则它们显示在零线下方。
*使用的数据类型、它们的单位和关联物种在“开始值”轴标签上可见（当鼠标指针悬停在上方时，所有这些都可以在工具提示中看到）。
*在任何其他图形上选择数据时，都会突出显示相应的数据。
*无法在此图形上选择数据。该图响应KPPC上的选择。
*有关选择（在KPPC上进行）的详细信息，可在下面的笔刷信息第节。

其他信息：
*突出显示其中一个图形（概览、PC、SPM）上的数据条目，突出显示所有其他图形上的相同数据（及其在KPPC、KPSP上的参数）.
*在KPPC图上突出显示动力学参数数据，在其他图（概览、PC、SPM、KPSP）上突出显示匹配条目。每个参数都属于一个条目。一个条目可以有多个参数。
*有关选择的详细信息可以在下面的笔刷信息第节。
*使用“重置突出显示".
*索引属性只是结果的顺序编号，不能用于进一步搜索。
*颜色：
*可以为图形选择不同的颜色方案（参见图片）。
*概述为每个属性使用完整的配色方案。
*可以手动选择用于PC和SPM轴着色的属性，否则它会在Overview中的列排序时更改。
     *也可以手动选择用于为KPPC轴（和KPSP）着色的属性（并且在Overview中对列进行排序时不会更改）。
*可以使用“NULL（“-”）值颜色“。默认颜色是所选配色方案中褪色的最小颜色。用户可以选择另一种颜色，该颜色与所选配色方案相结合，可提供更多对比度和可见性（红色、绿色、蓝色、青色、品红色、黄色、黑色）。更改使用的颜色方案时，空颜色将重置为该方案的默认颜色（褪色最小颜色）。注意着色（“PC，SPM：按轴着色”）或通过特定键/轴（包含空值）对概述进行排序（并因此对PC和SPM进行着色），使空值在PC和SPM图上清晰可见。为了使空值颜色在KPPC和KPSP图上可见，它们需要按该键/轴（“KPPC、KPSP：按轴着色").
*生成的图形的屏幕截图可以与solr搜索表达式一起下载。
*将指针悬停在短记号名称（三个点）上会显示全名。
*温度单位为摄氏度（°C）。
*概述目前显示最多10000个数据，PC和SPM最多400个（不要过于混乱）。勾选可关闭PC和SPM的数据限制“允许更多数据”在GUI中。只有当数据条目数在400和10000之间时，才会显示此选项。
笔刷信息