水稻基因组注释项目简介

2021年7月1日——Buell实验室已经搬到佐治亚大学了！水稻基因组注释项目（RGAP）网站的新URL是Rice.uga.edu。

2013年2月6日-A纸张描述统一的Os-Nipponbare-Reference-IRGSP-1.0假分子和密歇根州立大学水稻基因组注释项目第7版已在该杂志上发表大米.

水稻基因组注释项目数据库和资源是国家科学基础项目并为水稻提供序列和注释数据基因组。

该网站提供了日本水稻亚种的基因组序列并对12条水稻染色体进行了注释。这些数据可通过以下途径获得搜索页面和我们的基因组浏览器，提供注释数据。

第7版-统一水稻假分子

与研究人员合作国家农业生物科学研究所农业基因组研究中心在日本筑波，我们已经准备好了水稻假分子的最终组装。这些假分子序列现在在水稻基因组注释项目（RGAP）和水稻注释项目数据库（RAP-DB）/国际水稻基因组测序项目进行这项工作是为了让研究人员能够轻松比较两个项目的注释。RGAP和RAP-DB创建的基因位点、基因模型和相关注释是独立衍生的，但这两个水稻注释项目用于生成这些注释的伪分子现在是相同的，并且可以很容易地进行比较。描述最终水稻假分子组装产生的手稿正在准备中。

其他网站/数据库对水稻基因组注释项目（RGAP）水稻基因模型的使用

虽然许多研究人员利用RGAP基因座、基因模型和转录本拥有数据库和基因组浏览器，这些网站可能有过时的注释和可能修改或进一步注释了我们的官方基因集。所有RGAP水稻基因名称的格式为LOC_Os##g#####，如我们的命名页面.RGAP水稻基因是使用从头开始基因预测从Fgenesh开始，然后通过PASA程序进行改进和/或修改使用其他从头开始基因预测软件与水稻全长cDNA和EST对齐。我们的基因集完全是“内部”构建的，而不是等同于RefSeq、RAP、SwissProt或UniProt的注释。因为我们可以不能保证其他网站上标记为MSU/TIGR RGAP基因的数据实际上，我们建议用户始终参考水稻基因组注释项目对于我们真实和当前的RGAP水稻基因数据。请注意，虽然我们不能阻止用户下载我们的整个基因组浏览器，我们不赞助或批准公开重新显示我们的水稻基因组浏览器。