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msBayes（贝叶斯）
msBayes（发音为em-es-bayeszzz）允许复杂和灵活比较谱系地理推断。更具体地说，您可以测试同时发散或在多个共同分布的类群（种群）对之间的定殖和/或物种）。它使用分层近似贝叶斯计算（HABC）估计给定DNA序列数据的超参数。HABC公司算法使用ms的有限位置版本，即经典的合并Dick Hudson编写的模拟器。
层次模型将不确定性纳入每一组分类单元配对人口统计参数（子参数），同时进行估计描述中同余的超参数共分布分类单元对之间的差异/定殖时间。
此程序已开发通过迈克希克森,伊莱斯塔尔黄文，以及直木武林并根据GNU公共许可证发布。
msBayes在Linux、Mac OS-X和大多数POSIX系统上运行。尽管你需要使用命令行界面，这是公平的很简单。安装说明书和用户文档可用。这里还有其他提示对于不能由于缺少根目录，安装所需的程序（超级用户）访问计算机。还可以查看其他提示、脚本迈克的主页.
新闻
2014年3月5日，修复了与较新VGAM R软件包的兼容性。Mac二进制文件现在应该可以在任何版本的Mac OS-X中运行。如果当前版本有效，则无需升级到此版本。2013年6月11日，修复了一个小错误，该错误在包含无多态性的基因座时触发。
2012年5月10日，修复了一个小而烦人的错误。这是非常罕见的msbayes.pl暂停而未完成所有操作的实例仿真。现在已经修复，我们强烈建议您更新使用此版本。2012年2月22日，发布带有错误修复的新版本。
2010年5月19日，多焦点版本的msBayes（MTML-msBayes）发布！
早期版本可能包含错误，因此请更新到此最新版本版本。
下载
当前版本：20140305
二元的
- 转速管理器这些二进制文件是静态链接的，因此它应该在大多数情况下工作不安装GSL的发行版。但您确实需要安装中描述的其他组件（即R和R附加包）安装说明
- Mac OS-X(英特尔)
是的在Mac OS-X 10.8上编译。GSL是静态链接，所以您不需要安装它。文档不包括在内，但您可以从源发行版中获取它们。
对于Mac用户，我强烈建议您执行以下操作：
要在主目录中安装它，请在中执行以下操作Terminal.app（我假设您将二进制文件下载到您的桌面）。
光盘；tar xzvf桌面/msbays-mac-xxxxxxxx.tgz-C~
用适当的版本号替换xxxxxxxx。如果您正在使用游猎浏览器，它可能会自动解压缩并将其放在您的下载目录中。然后试试这个：
光盘；tar xvf下载/msbays-mac-xxxxxxx.tar-C~
不要忘记设置PATH环境变量以包含$HOME/bin。
旧版本
最后一个单基因座版本：20081106这是使用单位点数据集的旧版本。多焦点版本（20100519及更新版本）可以进行单基因座分析，它有额外的功能。所以请使用较新的版本。配置文件的格式略有更改，但将旧的批处理配置文件转换为更新的格式。
二元的
- 转速管理器
