L（左）局部A类广告中的怀旧M（M）固定的P（P）人口
登记表和许可证协议


灯是一个用于推断本地特定祖先的软件包最近混合的人口。它包括以下几个版本如下所述。

灯-LD混合个体的基因型以及近似混合祖先的参考单倍型面板并输出每个基因的估计等位基因数每个个体每个基因座的祖先。

LAMP-LD包还包括该程序HAP灯，其中在可获得高质量阶段时处理单倍型数据，以及利用三核族设计来提高估计精度。

灯-LD基于在层次隐马尔可夫模型。它可以处理2,3或5个混合种群每个样本的处理时间使其适合分析大型密集SNP面板的数据集。

程序的描述可以是在以下位置找到：原始程序灯不使用LD和因此不太准确，但在SNP密度不够高或祖先单倍型未知。原始版本的描述如下：的新版本灯（lamp-2.3及更高版本）使用改进的建模重组事件，导致最近的精确度更高祖先种群相近的混合种群相关（例如，美籍欧洲人或日籍华人等），以防祖先的种群是已知的。对这些改进进行了描述论文中：程序LAMP（LAMP-2.5）的最新版本使用相同的算法为lamp-2.3，但它包含一些错误修复。请检查有关详细信息，请参阅手册。

说明：
  1. 此软件仅可免费用于学术用途。用户如对商业应用感兴趣，请联系Eran Halperin博士（电子邮件：heran'AT'icsi.berkeley.edu）。
  2. 填写下面的申请表。所有字段都是必填的。
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为了便于引用，我们请求您引用Sankaraman et如果您使用该方法的非监督版本（即祖先种群未知），请引用Pasaniuc等人。，2009年，如果您使用有监督的版本，其中祖先种群已知。

许可协议：

被称为LAMP的计算机软件（“LAMP”或“The Software”）是在Sriram Sankaraman博士、Bogdan Pasaniuc博士、Srinath Sridhar博士和Gad博士的研究Kimmel、Michael Jordan博士和Eran Halperin博士（“研究人员”）伯克利国际计算机科学研究所（“ICSI”）。国际集成电路协会鼓励学术机构的研究人员使用LAMP（“被许可方”）用于非商业研究目的以下条款和条件：按“同意并接受”button，您和您的机构同意受以下条款的约束。

被称为LAMP-LD和LAMP-HAP的计算机软件（“LAMP-LD”或“The Software”）是在Yael Baran、Sriram Sankaraman博士、Bogdan Pasaniuc博士和Eran Halperin博士（“研究人员”）在伯克利国际计算机科学研究所（“ICSI”）和Tel-Avi大学（“TAU”）。TAU和ICSI鼓励学术机构的研究人员使用LAMP-LD（“被许可方”）用于非商业研究目的以下条款和条件：按“同意并接受”button，您和您的机构同意受以下条款的约束。

  1. 被许可方在此被授予非决定性的、不可转让的仅出于非商业目的使用LAMP和/或LAMP-LD的许可学术研究。此类研究不包括赞助的研究由商业实体提供。
  2. 为免生疑问，特此澄清上述LAMP和/或LAMP-LD的使用许可不包括任何义务或承诺提供任何伴随服务或改进。
  3. 被许可方同意不分销或转让LAMP和/或LAMP-LD或任何将其部分、副本或衍生物发送至另一地点或任何第三方。
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  5. 被许可方同意不反编译、反向工程、，拆卸，修改和/或创建软件的衍生作品。
  6. 被许可方承认LAMP和LAMP-LD是研究工具，仍在这个发展阶段。因此，它不是无误差、准确、，完整、有用、适用于任何特定应用或免费对任何权利的侵犯。本软件按原样授权，完全由被许可方承担风险。
  7. 本协议中的任何内容均不得视为保证或TAU、ICSI或研究人员代表LAMP和/或LAMP-LD和其使用，包括但不限于上述通用性，任何特定用途的准确性、安全性或适用性。
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