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生物学
国际标准编号:2059-7983

2004年11月发行

突出显示的插图

封面插图:蛋白质组蛋白甲基转移酶SET 7/9的电子密度图[西格玛]根据峰值波长Se-SAD数据计算。相位由绿洲-2004年,由改进糖尿病数据由S.J.Gamblin博士和B.Xiao博士提供。该蛋白质最初由J.R.Wilson测定等。[(2002),单元格,111,105-115]使用MAD方法。原始作者的精细结构模型叠加在电子密度图上(第1987页).

研究论文


《水晶学报》。(2004).D类60,1929-1934
https://doi.org/10.107/S090744904020645
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人NADH-细胞色素的结构b条51.75时的还原酶?分辨率与大鼠NADH-细胞色素的分辨率相同b条5还原酶,但Pro268Thr取代引起的大的主链转移除外。五种突变似乎与细胞色素有关b条5.

《水晶学报》。(2004).D类60,1935-1942
https://doi.org/10.107/S090744904021390
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在CSD中的肽分子中寻找巢穴,即蛋白质中常见的三氨基酸残基阴离子结合基序。发现37个。一种,在抗生素万古霉素中,具有结合细菌细胞壁前体肽的C末端羧酸基的功能。

《水晶学报》。(2004).D类60,1943-1948
https://doi.org/10.107/S090744904021572
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在研究HIV-1蛋白酶与新型苯去甲抑素抑制剂复合物的过程中,发现两个抑制剂分子与该酶结合,其中一个以非生产模式结合。讨论了该抑制剂分子在蛋白质界面上的接触对晶体质量的贡献。

《水晶学报》。(2004).D类60,1949-1957
https://doi.org/10.107/S090744904021791

《水晶学报》。(2004).D类60,1958-1963
https://doi.org/10.107/S090744904021730
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分析了辐射损伤对碘化索马丁晶体的影响。结果表明,以RIPAS(辐射损伤诱导相位与异常散射)的形式将异常和同构信号结合起来,有利于定位子结构和后续相位。

《水晶学报》。(2004).D类60,1964-1970
https://doi.org/10.107/S090744904021912
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晶体结构大肠杆菌精氨琥珀酸裂解酶测定值为2.44分辨率;在这种结构中,一个活性中心与两个磷酸根离子络合,采用闭合构象。

《水晶学报》。(2004).D类60,1971-1980
https://doi.org/10.107/S090744904022292
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这个D类,L(左)-交替肽H-(L(左)-提尔-D类-泰尔)4-L(左)-Lys-OH采用禾本科菌素a样结构。旨在利用可用高分辨率数据的碎片搜索策略(1.3进行了测试。

《水晶学报》。(2004).D类60,1981-1986
https://doi.org/10.107/S090744904023005
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从头开始三元复合物的结晶鼠疫耶氏菌毒力因子YopN、SycN和YscB只能在表面暴露赖氨酸残基的还原甲基化后获得。该案例研究还表明,这种修饰可以安全地应用于多蛋白复合物和硒代蛋氨酸取代的样品,突出了其作为结晶工具的一般潜力,即使在高通量环境中也是如此。

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研究了误差项对直接法SAD定相的影响。提出了一种在误差项中自动调整比例因子的方法。

《水晶学报》。(2004).D类60,1991-1996
https://doi.org/10.107/S090744904023893
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基于初始直接法SAD定相的自动建模产生的结构片段被反馈到直接法概率公式中,以增强定相能力并有利于蛋白质结构求解的自动化。

结构基因组学论文


《水晶学报》。(2004).D类60,1997-2002
https://doi.org/10.107/S090744904021146
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X射线晶体结构嗜热杆菌RraA已求解为2.3奥分辨率。

结晶纸


《水晶学报》。(2004).D类60,2003-2005
https://doi.org/10.107/S090744904019869
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莽草酸途径的最后一步由分支酸合成酶(CS)催化。结晶试验的优化允许均匀重组CS从结核分枝杆菌.

《水晶学报》。(2004).D类60,2006-2008
https://doi.org/10.107/S090744904020232

《水晶学报》。(2004).D类60,2009-2012
https://doi.org/10.107/S090744904020530
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极端微生物的全长单链DNA结合蛋白(SSB)超嗜热菌已表示为大肠杆菌获得了纯化结晶和初始X射线数据。

《水晶学报》。(2004).D类60,2013-2015
https://doi.org/10.107/S090744904020517
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获得了小鼠冠状病毒-小鼠肝炎病毒尖峰蛋白融合核心的初步晶体学数据。

《水晶学报》。(2004).D类60,2016-2018
https://doi.org/10.1107/S907444904020475

《水晶学报》。(2004).D类60,2019-2021
https://doi.org/10.107/S090744904020608
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由299个氨基酸残基组成的人肝调节钙素在大肠杆菌在聚乙二醇4000作为沉淀剂的情况下,通过蒸汽扩散法进行纯化和结晶。

《水晶学报》。(2004).D类60,2022-2024
https://doi.org/10.107/S090744904020827
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VCBP3,一种来自原球茎的免疫球蛋白样蛋白佛罗里达双歧杆菌科具有“原始”抗原受体的特征,已被结晶并收集了完整的本地数据集至2.4奥分辨率。来自两种不同结晶条件的异形晶体与空间群一致P(P)121和P(P)221,带单元间参数=b条= 58.99,c(c)= 79.21Å, α = β = 90, γ = 120°.

《水晶学报》。(2004).D类60,2025-2027
https://doi.org/10.107/S0907444904020724

《水晶学报》。(2004).D类60,2028-2030
https://doi.org/10.107/S090744904021031
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液泡分选受体(VSR)蛋白以序列特异的方式靶向溶解液泡的配体。净化自无孢子虫属S2细胞、结晶和初步X射线衍射研究拟南芥已执行VSR,AtBP80b。

《水晶学报》。(2004).D类60,2031-2034
https://doi.org/10.107/S090744904021134
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谷氨酸消旋酶来自枯草杆菌在以下条件下结晶L(左)-适合于结构测定的谷氨酸形式。

《水晶学报》。(2004).D类60,2035-2037
https://doi.org/10.107/S090744904021110
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Aall-A和Aall-B是两种新的异二聚体蛇毒C型凝集素样蛋白(sv-CLPs),从蛇毒中纯化得到尖吻蝮来自中国安徽,并结晶。

《水晶学报》。(2004).D类60,2038-2039
https://doi.org/10.1107/S907444904021183
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这个M.奥雷德斯凝集素(MOA)已结晶。晶体衍射各向异性达到2.5奥分辨率。已获得3.0的完整X射线数据集奥分辨率。

《水晶学报》。(2004).D类60,2040-2043
https://doi.org/10.107/S09074490402116X
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心尖膜抗原1的外质区间日疟原虫以两种晶体形式表达和结晶。相位是通过使用铂衍生物的MAD技术获得的。

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水形成NADH氧化酶三藩草已在太空群中结晶P(P)212121X射线衍射数据达到1.85已收集分辨率。

《水晶学报》。(2004).D类60,2048-2050
https://doi.org/10.107/S090744904021201
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视黄酸受体β配体结合结构域已被表达并结晶,结合到具有或不具有共激活肽(SRC-1)的合成类视黄醇(TTNPB)上。

《水晶学报》。(2004).D类60,2051-2053
https://doi.org/10.107/S090744904021596
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因子XIIa Kazal型抑制剂感染素4的晶体晚疫旋毛虫,衍射到1.8光学分辨率,属于正交空间群P(P)212121,带有单位-细胞参数= 25.89,b条= 45.64,c(c)= 57.41Å.

《水晶学报》。(2004).D类60,2054-2057
https://doi.org/10.107/S090744904021584
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晶体之间的复合体间日疟原虫性阶段25kDa蛋白Pvs25和阻断疟疾传播的Fab衍射X射线至3.5Å. 每个不对称单元预测有两个复杂分子。

《水晶学报》。(2004).D类60,2058-2060
https://doi.org/10.107/S090744904021638
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墨西哥毒,一种半胱氨酸蛋白酶,是从热带植物的乳胶中提取出来的Pileusmexicanus公司纯化并结晶。晶体属于太空群P(P)21它们将X射线衍射到2.1奥分辨率。

《水晶学报》。(2004).D类60,2061-2062
https://doi.org/10.107/S090744904021754
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吡哆醛4-脱氢酶来自黄体微杆菌已通过坐滴蒸发扩散法结晶。晶体为单斜晶,属于空间群C类2,带单位-细胞参数= 107.0,b条=56.7,c(c)= 130.2Å, β = 103.6°. 衍射数据从单晶收集到2.0Å.

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唾液酸酶编码的三种唾液酸酶之一的催化域产气荚膜杆菌基因组已经亚克隆和结晶。这个50的衍射kDa域超过0.92奥将详细介绍这种酶超家族的机制酶学。

《水晶学报》。(2004).D类60,2067-2069
https://doi.org/10.107/S090744904021985

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亚硫酸盐脱氢酶来自中篇小说已经结晶。晶体衍射至少1.8分辨率和属于空间组P(P)21212,带单位-细胞参数= 97.5,b条= 92.5,c(c)= 55.9Å.

《水晶学报》。(2004).D类60,2073-2075
https://doi.org/10.107/S090744904022425
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野生型和两个apo色氨酸酶突变体的晶体大肠杆菌属于空间组F类222,衍射至1.9Å.

《水晶学报》。(2004).D类60,2076-2077
https://doi.org/10.1107/S907444904022632
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一种蛋白质二硫氧化还原酶超嗜热菌首次结晶。晶体属于空间群R(右)32,衍射到2.4奥分辨率。

《水晶学报》。(2004).D类60,2078-2080
https://doi.org/10.107/S090744904022735
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钩子是细菌鞭毛的一个短而高度弯曲的部分,起着万向节的作用,是一个约120个单蛋白FlgE(42kDa)。报道了一个31KDa的FlgE片段的表达、纯化、结晶和衍射数据采集,该片段因其强大的聚合能力而极难结晶。

《水晶学报》。(2004).D类60,2081-2083
https://doi.org/10.1107/S907444904022668
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壳聚糖酶来自芽孢杆菌菌株K17属于糖苷水解酶家族8,具有II亚类特异性,已结晶为活性和非活性状态对应的两种形式。

《水晶学报》。(2004).D类60,2084-2086
https://doi.org/10.107/S09074490402267X
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小鼠自分泌运动因子在没有和存在碳水化合物磷酸抑制剂的情况下结晶。使用同步辐射收集衍射数据。

《水晶学报》。(2004).D类60,2087-2090
https://doi.org/10.107/S090744904024102
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水疱性口炎病毒磷酸蛋白的稳定结构域结晶。这些晶体属于太空群P(P)41212或P(P)4212,带单位-细胞参数=b条=74.50,c(c)= 156.84λ,衍射数据收集到2.75Å.

《水晶学报》。(2004).D类60,2091-2094
https://doi.org/10.107/S090744904023972
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重组体的生产和结晶大肠杆菌谷氨酸-5-激酶是一种催化脯氨酸生物合成第一步和反馈控制步骤的酶,是氨基酸激酶家族的成员。除了催化机制外,这种酶还包含PUA假定的RNA结合域,赋予其基因表达调控特性。

《水晶学报》。(2004).D类60,2095-2097
https://doi.org/10.107/S090744904024126
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获得了人2′,3′-环核苷酸3′-磷酸二酯酶(hCNP-CF)催化片段的晶体。晶体将X射线衍射到1.8奥分辨率。

《水晶学报》。(2004).D类60,2098-2099
https://doi.org/10.107/S09074490402428X
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制备了PEX1 N端畴晶体。晶体属于太空群P(P)1P(P)2,带有单位-细胞参数=b条= 63.5,c(c)= 33.5每个晶体不对称单元含有一个蛋白质分子。采集的强度数据集分辨率为2.05Å.

《水晶学报》。(2004).D类60,2100-2103
https://doi.org/10.107/S090744904023868
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一种过敏相关蛋白的纯化、鉴定及初步晶体学研究五爪纲进行种子接种。蛋白质的晶体衍射约为2.1光学分辨率不表示与任何已知晶体结构的蛋白质同源。

《水晶学报》。(2004).D类60,2104-2106
https://doi.org/10.107/S0907444904024114

《水晶学报》。(2004).D类60,2107-2109
https://doi.org/10.107/S090744904024229
链接到html
用悬挂滴气相扩散法在DDAO络合物中结晶了马PLRP2的蛋白水解形式。本地数据已收集到2.9奥分辨率。

短通信


《水晶学报》。(2004).D类60,2110-2113
https://doi.org/10.1107/S907444904022474

补遗和勘误表


《水晶学报》。(2004).D类60,2114
https://doi.org/10.107/S09074490402390X
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