结晶学报D辑
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结构
生物学
第60卷
|
第4部分
国际标准编号:2059-7983
2004年4月发行
封面插图:
这张使用Metripol成像系统产生的双折射取向图像说明了溶菌酶球晶中心周围针状晶体排列的对称性(
第696页
).
研究论文
《水晶学报》。
(2004).
D类
60
,
621-629
https://doi.org/10.107/S090744904000915
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用相干X射线衍射和成像研究结晶溶菌酶的缺陷
胡志伟(Z.W.Hu)
,
Y.S.Chu(朱棣文)
,
B.赖
,
B.R.托马斯
和
A.A.切尔诺夫
在一个含有4
4
0~16.7的摇摆曲线宽度
弧秒。
结果表明,脱水导致微观结构发生显著变化,并且4
4
0摇摆曲线。
阅读文章
《水晶学报》。
(2004).
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60
,
630-637
https://doi.org/10.107/S090744904001805
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钠结合的三斜性鸡蛋白溶菌酶晶体的相变
K·哈拉塔
和
秋叶T
用X射线衍射法测量了三斜溶菌酶晶体的相变,并确定了转变晶体的结构为1.1
奥分辨率。
PDB参考
:
I型晶体,1v7s,r1v7ssf
;
II型晶体,1v7t,r1v7tsf
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(2004).
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60
,
638-645
https://doi.org/10.107/S090744904002148
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芽孢磷脂酶中的金属:响应调节剂Spo0F与锰的结合
D.穆霍帕迪亚
,
美国参议员
,
J.扎普夫
和
K.I.Varughese公司
本文报道了响应调节剂Spo0F与锰配合物的晶体结构,并探讨了锰和镁参与磷酰转移的不同可能性。
PDB参考
:
金属结合短管0F,1pey,r1peysf
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(2004).
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646-655
https://doi.org/10.1107/S0907444904002094
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四氢喹唑啉类反叶酸与人和人的配合物的结构测定
卡氏肺孢子虫
双氢叶酸还原酶:酶选择性与立体化学的关系
V.科迪
,
J.R.勒夫特
,
W.庞伯恩
,
A.冈吉
和
S.F.奎纳
报道了四氢喹唑啉反叶酸(6
对
,6
S公司
)-2,4-二氨基-6-(1-吲哚甲基)-5,6,7,8-四氢喹唑啉及其三甲氧基类似物(6
对
,6
S公司
)-2,4-二氨基-6-(3′,4′,5′-三甲氧基苄基)-5,6,7,8-四氢喹唑啉与人二氢叶酸还原酶(DHFR)和
卡氏肺孢子虫
(pcDHFR)来源。
PDB参考
:
hDHFR–(1)复合物,1s3w,r1s3wsf
;
pcDHFR–(1)复合物,1s3y,r1s3ysf
;
hDHFR–(2)复合物,R3(1),1s3u,r1s3usf
;
hDHFR–(2)复合物,R3(2),1s3v,r1s3vsf
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《水晶学报》。
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60
,
656-664
https://doi.org/10.107/S090744904002239
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γδT细胞配体T10单斜晶体形式中的组合伪亚面体孪晶、非晶体学对称性和伪平移
M.G.鲁道夫
,
C.温格伦
,
M.P.克劳利
,
Y.Chien先生
和
I.A.威尔逊
γδT细胞配体T10的晶体结构是通过分子替换来确定的,分子替换使用的是显示伪平移和非晶体学对称性的高度赝面体孪晶单斜晶体的数据。
本文介绍了T10晶体中孪晶的检测和处理,并分析了孪晶对细化的影响。
对PDB的研究揭示了一些单斜晶体中可能出现孪晶的情况,但这些情况可能没有被注意到。
PDB参考
:
γδT细胞配体T10,1r3h,r1r3hsf
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《水晶学报》。
(2004).
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60
,
665-673
https://doi.org/10.107/S09074490400232X
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商陆根中两种凝集素的结构(
美洲商陆
)
藤井裕久
,
M.Hayashida先生
,
哈马苏先生
,
石黑一郎
和
Y.哈塔
商陆根中两种凝集素的晶体结构(
垂序商陆
)已通过分子置换解决。
在碳水化合物结合位点和C末端区域的相对排列中观察到结构特征。
PDB参考
:
PL-D1,尺骨,尺骨
;
PL-D2、1uha、r1uhasf
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60
,
674-679
https://doi.org/10.107/S090744904002549
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2.2人体横框的结构
奥数分辨率
一、杉木
,
C.佐佐木
,
长谷川(T.Hasegawa)
,
T.科诺
,
S.Sugio公司
,
H.森山
,
M.Kasai先生
和
T.松崎
一种新的晶体形式的转译蛋白,一种八聚体人类DNA/RNA-结合蛋白,已在2.2
奥分辨率。
PDB参考
:
翻译,1j1j,r1j1jsf
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(2004).
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60
,
680-685
https://doi.org/10.107/S090744904002896
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d(CGCAATTGCG)五种晶体结构的DNA变异性
N.阀门
,
G.赖特
,
R.A.斯坦纳
,
G.N.穆尔舒多夫
和
J.A.苏比拉纳
双工d的一种新结构(CGCAATTGCG)
2
显示了。
它含有钴
2+
并衍射到1.6
Å.
所得结果与先前报道的同一双工的四种结构进行了比较。
中心六聚体序列CAATTG在所有条件下都具有几乎恒定的构象,而末端碱基对在每种情况下都不同。
PDB参考
:
d(CGCAATTGCG),1s23,r1s23sf
NDB参考
:
BD0066型
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60
,
686-695
https://doi.org/10.107/S090744904003002
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结合长波长硫相位和辐射损伤诱导相位确定新结构
M.S.Weiss先生
,
G.曼德
,
R.海德里希
,
K.Diederichs公司
,
尤·埃姆勒
和
E.沃肯廷
115-氨基酸残基蛋白DsvC的结构是通过长波长硫相位和辐射损伤诱导相位相结合来确定的。
PDB参考
:
异化亚硫酸盐还原酶γ亚基1sau,r1sausf
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《水晶学报》。
(2004).
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60
,
696-702
https://doi.org/10.107/S090744904003154
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使用双折射评估结晶液滴
A.埃希利埃
,
R.L.格雷泽
,
V.Fülöp
和
M.A.Geday先生
描述并讨论了一种自动双折射技术,用于评估结晶液滴,特别是沉淀的含量。
阅读文章
结晶纸
《水晶学报》。
(2004).
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60
,
703-705
https://doi.org/10.107/S09074490400109X
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牛糖脂转移蛋白的结晶及X射线分析
G.西部
,
Y.尼马尔姆
,
T.T.艾伦内
,
H.基德隆
,
P.马特朱斯
和
T.T.萨尔米宁
糖脂转移蛋白(GLTP)是一种24
促进糖脂在双层膜之间转移的kDa碱性细胞溶质蛋白
在体外
,但它
体内
函数未知。
本文首次报道了牛GLTP的结晶和初步的X射线分析。
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(2004).
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60
,
706-708
https://doi.org/10.107/S090744904001398
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结晶和初步X射线分析
间日疟原虫
性阶段25
kDa蛋白Pvs25,疟疾的一种阻断传播的候选疫苗
A.K.萨克森纳
,
A.索尔
和
D.N.加博奇
抗疟疾候选疫苗Pvs25形成晶体,衍射为2.3
已经收集了奥数和几个完整的数据集。
赖氨酸残基的还原甲基化显著改善了晶体的衍射质量。
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(2004).
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60
,
709-711
https://doi.org/10.107/S090744904001519
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尿苷磷酸化酶的纯化、结晶及初步X射线分析
鼠伤寒沙门菌
M.V.Dontsova先生
,
Y.A.萨沃奇基纳
,
A.G.加布杜勒哈科夫
,
S.N.拜达科夫
,
A.V.利亚申科
,
M.Zolotukhina先生
,
L.Errais洛佩斯
,
M.B.加伯
,
E.Y.Morgunova公司
,
S.V.尼科诺夫
,
A.S.米罗诺夫
,
S.E.伊里克
和
A.M.米哈伊洛夫
尿苷磷酸化酶来自
鼠伤寒沙门氏菌
已经结晶。
初步的X射线衍射数据表明这些晶体属于空间群
P(P)
6
1(5)
.
阅读文章
《水晶学报》。
(2004).
D类
60
,
712-714
https://doi.org/10.107/S090744904001647
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人肿瘤蛋白SET/TAF-1β的纯化、结晶及初步X射线衍射分析
S.穆托
,
M.森达
,
N.阿达奇
,
T.铃木
,
R.Nagai先生
,
T.森达
和
M.Horikoshi先生
人癌蛋白SET/TAF-1β已通过坐滴法结晶。
完整的衍射数据集收集到2.8
使用同步辐射的光学分辨率。
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《水晶学报》。
(2004).
D类
60
,
715-717
https://doi.org/10.107/S090744904001854
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高温NAD依赖性谷氨酸脱氢酶的结晶和初步X射线衍射分析
岛热杆菌
M.W.Bhuiya先生
,
H.樱叶
,
K.Yoneda公司
,
T.Ohsima公司
,
T.Imagawa公司
,
N.卡图努马
和
H.Tsuge公司
超耐热NAD依赖性谷氨酸脱氢酶
铅。
群岛
已经结晶。
晶体衍射到最大分辨率为2.8
Å.
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《水晶学报》。
(2004).
D类
60
,
718-720
https://doi.org/10.107/S090744904001969
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普通食用菌的结晶及X射线初步研究(
双孢蘑菇
)凝集素
卡里佐先生
,
F.J.伊拉佐基
,
R.D.Lardone公司
,
G.A.挪威
,
J.A.科蒂诺
,
S.Capaldi公司
,
M.珀杜卡
和
H.L.摩纳哥
普通食用菌(
双歧杆菌
)凝集素已结晶成适合于X射线衍射研究的形式。
晶体衍射到2.2
奥分辨率。
阅读文章
《水晶学报》。
(2004).
D类
60
,
721-724
https://doi.org/10.107/S090744904002008
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真菌两个分离蛋白的基因设计、表达、结晶和初步衍射分析
灰鸡腿菇
:研究同一生物体内半乳糖凝集素功能多样性及其进化途径的模型
M.F.López-Lucendo先生
,
G.吉梅内斯·加列戈
,
D.N.W.库珀
,
H.-J.加比乌斯
和
A.罗梅罗
半乳糖凝集素是动物细胞中参与细胞粘附和生长调节的凝集素。
真菌的Cgl-1和Cgl-2
C.cinereus公司
是第一批来自动物王国以外的家庭成员。
本文描述了这两种原型半乳糖凝集素的基因设计、表达、纯化和结晶。
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《水晶学报》。
(2004).
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60
,
725-726
https://doi.org/10.107/S090744904001866
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水母鱼孵化酶HCE-1的结晶和初步X射线分析,
青鳉
N.库多
,
S.Yasumasu公司
,
I.岩内
和
M.Tanokura先生
采用挂滴蒸发扩散法,用聚乙二醇10结晶水母孵化酶,即高氯溶酶
000作为沉淀剂。
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《水晶学报》。
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60
,
727-729
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嗜热蓝藻生物钟蛋白KaiB的结晶及初步晶体学分析
细长热棒球菌
BP-1型
R.我是
,
K.伊马达
,
F.林石
,
T.乌祖马基
,
K.Namba公司
和
石村先生
嗜热蓝藻的KaiB和Cys-取代KaiB突变体
长枝木霉
BP-1已被表达为GST融合蛋白
大肠杆菌
纯化并结晶。
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《水晶学报》。
(2004).
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60
,
730-732
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定位于富含脂质的微区的高尔基体相关PR-1相关蛋白(GAPR-1)的结晶
M.R.Groves先生
,
A.库恩
,
A.亨德里克斯
,
S.Radke公司
,
R.L.塞拉诺
,
J.B.赫尔姆斯
和
一、正弦
一种植物病原相关蛋白的人类同源物,专门定位于高尔基体膜,已经结晶,晶体衍射为1.5
报告了分辨率。
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(2004).
D类
60
,
733-735
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保守性假想蛋白PAE2754的结晶和初步X射线分析
嗜气热杆菌
和双亮氨酸
→
用于MAD阶段化的Met突变体
K.Bäckbro公司
,
A.房间
,
E.N.贝克
和
V.L.Arcus公司
一种来自嗜热crenarchaeon的保守假设蛋白
嗜气芽孢杆菌
表达、纯化和结晶。
通过诱变引入了两个蛋氨酸残基,以便为MAD相位提供SeMet取代的晶体。
阅读文章
《水晶学报》。
(2004).
D类
60
,
736-739
https://doi.org/10.107/S090744904002252
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纯化和结晶
大肠杆菌
寡核糖核酸酶
T.J.菲德勒
,
H.A.文森特
,
Y.Zuo(左)
,
O.加夫里亚洛夫
和
A.马尔霍特拉
寡核糖核酸酶(Orn)是一种重要的3′-to 5′外核糖核酶,可降解小分子寡核糖核苷酸,在三种不同条件下结晶。
阅读文章
《水晶学报》。
(2004).
D类
60
,
740-742
https://doi.org/10.107/S090744904002318
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人GTPase RhoA与PDZ-RhoGEF DH/PH串联复合体的初步晶体学分析
A.奥列克西
,
H.巴顿
,
Y.德韦捷夫
,
M.珀迪
,
U.德雷温达
,
J.奥特莱斯基
和
Z.S.德雷温达
PDZ-RhoGEF和C末端截短RhoA的DH/PH串联在
大肠杆菌
作为TEV蛋白酶可清除融合蛋白,在N末端分别含有GST和六组氨酸标签。
通过凝胶过滤纯化无核苷酸DH/PH–RhoA复合物并结晶。
阅读文章
《水晶学报》。
(2004).
D类
60
,
743-745
https://doi.org/10.107/S09074490400229X
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NAD(H)结合域的结晶和初步晶体学分析
大肠杆菌
转氢酶
C.奥斯瓦尔德
,
T.约翰逊
,
S.Törnroth公司
,
M.Økvist先生
和
U.Krengel公司
来自
大肠杆菌
已经结晶。
晶体衍射至1.9
奥分辨率。
阅读文章
《水晶学报》。
(2004).
D类
60
,
746-748
https://doi.org/10.1107/S0907444904002410
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表达、纯化、结晶和初步晶体学研究
粪肠球菌
溶细胞素阻遏物CylR2
A.拉泽托
,
K.吉勒
,
W.哈斯
,
M.S.吉尔摩
,
M.Zweckstetter先生
和
S.贝克尔
这个
粪大肠杆菌
溶细胞素阻遏物CylR2构成了一个新的quorum-sensing系统的一部分。
阅读文章
《水晶学报》。
(2004).
D类
60
,
749-751
https://doi.org/10.107/S090744904002367
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一种罕见的III型聚酮合成酶PKS18的结晶和初步X射线晶体学研究
结核分枝杆菌
R.鲁克米尼
,
V.M.Shanmugam先生
,
P.萨克森那
,
R.S.戈哈勒
和
R.桑卡拉纳拉亚南
III型聚酮合酶PKS18来自
结核分枝杆菌
已结晶,以了解其不寻常的起始分子特异性。
阅读文章
《水晶学报》。
(2004).
D类
60
,
752-754
https://doi.org/10.107/S090744904002392
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人Rap1GAP的纯化、结晶及初步结构表征
O.道姆克
,
A.威廷霍弗
和
M.Weyand先生
Rap1GAP是小GTPase Rap1的GTPase激活蛋白家族的创始成员,已经过表达、纯化和结晶。
报告了从天然晶体中收集的数据。
阅读文章
《水晶学报》。
(2004).
D类
60
,
755-757
https://doi.org/10.107/S090744904002422
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与细菌冷休克蛋白结合的单牌DNA:初步晶体学和拉曼分析
R.比纳特
,
M.泽布
,
L.DostáL先生
,
A.费斯克
,
C.麦格
,
K.最大值
,
H.韦尔弗
,
J.巴尔巴赫
和
U.海涅曼
主要的冷休克蛋白
枯草芽孢杆菌
和
溶钙芽孢杆菌
是被描述为结合单链核酸的小寡核苷酸/寡糖结合折叠蛋白。
在这里,它们在脱氧六核苷酸(dT)的存在下结晶
6
.
阅读文章
《水晶学报》。
(2004).
D类
60
,
758-760
https://doi.org/10.107/S090744904002574
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水溶性转糖苷酶MltA的纯化、结晶及初步X射线分析
大肠杆菌
K.E.van Straaten公司
,
B.W.迪克斯特拉
和
A.-M.W.H.Thunnissen先生
介绍了一种可溶性形式的缺乏膜锚的裂解转糖苷酶MltA的结晶和初步X射线分析。
阅读文章
《水晶学报》。
(2004).
D类
60
,
761-763
https://doi.org/10.107/S090744904002665
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2-酮-3-脱氧葡萄糖酸激酶的结晶及初步晶体学分析
嗜热菌
E.稻垣祯一
,
尤基塔
,
M.Kumei先生
,
Y.Kajihara先生
和
T.H.塔希罗夫
2-酮-3-脱氧葡萄糖酸激酶的两种晶型
嗜热杆菌
已获得,并通过X射线衍射进行了表征。
阅读文章
《水晶学报》。
(2004).
D类
60
,
764-766
https://doi.org/10.107/S090744904003014
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死亡相关蛋白激酶催化域两种抑制剂复合物的结晶及初步X射线分析
A.Yamakawa
,
H.绪方
,
森田康夫
,
N.柴田
,
N.安都
,
H.Sanuki先生
,
K.山田
,
T.Hioki先生
,
石井(T.Ishii)
和
Y.Higuchi先生
采用坐滴气相扩散法,制备了死亡相关蛋白激酶催化结构域的单晶及其与两种抑制剂分子的配合物。
这两种抑制剂分子在产生的差异傅里叶图中都得到了明确的识别。
阅读文章
《水晶学报》。
(2004).
D类
60
,
767-769
https://doi.org/10.107/S090744904003117
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与天冬酰胺-tRNA合成酶相关的古天冬酰胺合成酶的结晶和初步X射线衍射数据
C.查伦
,
H.罗伊
,
M.布莱斯
,
R.Giegé
和
D.科恩
古生菌天冬酰胺合成酶A的晶体
P.阿比西
是一种与天冬酰胺-tRNA合成酶结构相关的酶,通过蒸汽扩散生长;
他们属于太空团体
C类
2和
P(P)
2
1
衍射到2.3和3.0
分别为:。
阅读文章
《水晶学报》。
(2004).
D类
60
,
770-772
https://doi.org/10.107/S090744904003221
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Y75N突变体的结晶和X射线分析
微小毛霉
胃蛋白酶与抑制剂复合
巴达索先生
,
V.达纳拉吉
,
S.P.木材
,
J.B.库珀
和
T.L.布伦德尔
Y75N突变体
微小毛霉
胃蛋白酶与人肾素抑制剂共结晶,并对晶体进行了分析。
阅读文章
《水晶学报》。
(2004).
D类
60
,
773-774
https://doi.org/10.107/S090744904003282
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酰基载体蛋白合成酶(AcpS)的结晶和初步X射线分析
金黄色葡萄球菌
D.L.道巴拉斯
,
E.M.威尔逊
,
T.黑色
,
C.斯特里克兰
,
B.M.拜尔
和
P.奥尔思
酰基载体蛋白合成酶
金黄色葡萄球菌
以两种晶体形式结晶。
收集的完整数据集的分辨率分别为1.65和1.8
分别为:。
阅读文章
《水晶学报》。
(2004).
D类
60
,
775-776
https://doi.org/10.107/S090744904003506
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假尿苷合成酶TruD的表达、纯化、结晶和初步衍射研究
大肠杆菌
爱立信大学
,
M.E.安德森
,
B.恩格瓦尔
,
P.诺德伦德
和
B.M.Hallberg先生
tRNA假尿苷合成酶TruD来自
大肠杆菌
已经过表达、纯化和结晶。
正交晶体衍射到2.4
使用同步辐射的光学分辨率。
阅读文章
《水晶学报》。
(2004).
D类
60
,
777-779
https://doi.org/10.107/S090744904004366
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表达、纯化、结晶和X射线晶体初步研究
结核分枝杆菌
硫氧还蛋白还原酶
M.阿基夫
,
R.Chauhan先生
和
S.C.曼德
重组
结核分枝杆菌
硫氧还蛋白还原酶已被表达、纯化和结晶。
衍射数据收集到3
描述了光学分辨率和初步的X射线衍射分析。
阅读文章
《水晶学报》。
(2004).
D类
60
,
780-783
https://doi.org/10.107/S090744904001544
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双功能二氢叶酸还原酶-胸苷酸合成酶的表征、结晶和初步X射线分析
恶性疟原虫
P.Chitnumsub公司
,
J.亚瓦尼亚马
,
J.瓦尼赫塔南库
,
S.Kamchonwongpaisan公司
,
M.D.Walkinshaw博士
和
Yuthavong先生
野生型和突变型(C59R+S108N)二氢叶酸还原酶–胸苷酸合成酶(PfDHFR-TS)酶来自
恶性疟原虫
乙胺嘧啶衍生物与NADPH、dUMP和Pyr39或Pyr30络合后,保留与突变酶的结合亲和力,已使用微配合法结晶。
还对婴儿油在微胶囊结晶中的应用进行了初步研究。
阅读文章
更正
《水晶学报》。
(2004).
D类
60
,
784-787
https://doi.org/10.107/S090744904002628
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hnRNP K第三KH结构域与单链DNA复合物的结晶、microPIXE和初步晶体学分析
P.H.Backe公司
,
R.B.G.拉维利
,
E.加曼
和
S.库萨克
人hnRNP第三KH结构域的共结晶
带有15-mer ssDNA的K产生了属于三角空间群的杆状晶体
P(P)
三
1
21(单元-单元参数
一
= 54.0,
c(c)
= 149.7
?)并衍射至2.4
奥分辨率。
阅读文章
《水晶学报》。
(2004).
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60
,
788-791
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识别人类血型抗原的重组Fab的纯化、结晶和X射线衍射分析
S.-C.宋
,
K·谢
,
M.Czerwinski先生
,
S.L.斯皮塔尼克
和
J.E.Wedekind公司
描述了抗血型Fab片段NNA7的纯化、结晶和X射线衍射分析,以及初始相位信息。
阅读文章
短通信
《水晶学报》。
(2004).
D类
60
,
792-795
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牛碳酸酐酶II在1.95的结构
奥数分辨率
R.斋藤
,
佐藤(T.Sato)
,
A.Ikai
和
N.田中
牛碳酸酐酶II(BCA II)的晶体结构已测定为1.95
分子置换拆分。
PDB参考
:
牛碳酸酐酶II,1v9e,r1v9esf
阅读文章
《水晶学报》。
(2004).
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60
,
796-799
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正态模式分析在解决复杂的分子置换问题中的潜力
K.Suhre公司
和
Y.-H.Sanejouand公司
在最低频的正常模式方向上扰动蛋白质结构模型可以使其成为解决复杂的分子再安置问题的有利模板。
阅读文章
补遗和勘误表
《水晶学报》。
(2004).
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60
,
800
https://doi.org/10.107/S090744904004998
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红细胞生成素的金属取代衍生物
巴氏梭菌
.附录
马赫先生
,
M.十字架
,
M.C.J.威尔斯
,
J.M.格斯
和
A.G.婚礼
论文的附录
马希尔
等。
(2004),
《水晶学报》。
D类
60
, 298–303
.
阅读文章
《水晶学报》。
(2004).
D类
60
,
801
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微种子基质筛选以改善酵母胞嘧啶脱氨酶晶体。
勘误表
G.C.伊雷顿
和
B.L.斯托达德
论文的勘误表
Ireton&Stoddard(2004),
《水晶学报》。
D类
60
, 601–605
.
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《水晶学报》。
(2004).
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60
,
802
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d(GCGAAGC)和d(GCGA AAGC)的结构(四方形式):剪切G·a对的伙伴交换形成功能性G·a×a·G交叉。
勘误表
T.苏纳米
,
J.近藤
,
一、Hirao
,
渡边捷昭
,
K.三浦
和
A.塔克纳卡
作者的论文勘误表
Sunami公司
等。
(2004),
《水晶学报》。
D类
60
, 422–431
.
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