（IUCr）结晶学报第D节第59卷第1部分，2003年1月

《水晶学报》。(2003).D类59,1
doi:10.1107/S090744490202245X

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E.N.贝克和Z.道特

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用先进的蛋白质结晶设备在还原颗粒环境中研究蛋白质晶体生长的物理方面

A.维加拉,B.洛伯,A.扎加里和R.Giegé

评述了先进蛋白质结晶设备对蛋白质结晶的物理化学见解。

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人FKBP52的N末端结构域

P.李,丁毅（Y.Ding）,B.吴,C.舒,B.沈和Z.饶

人FKBP52的N末端结构域的结构通过分子置换法确定为2.4 Å. 整体结构与FKBP12非常相似，并讨论了该蛋白的结构-功能关系。

PDB参考:FKBP52，1n1a

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2的结构和催化机理-C类-甲基-D类-赤藓醇2,4-环二磷酸（MECDP）合成酶，异戊二烯合成非甲羟戊酸途径中的一种酶

H.Kishida（基希达）,T.瓦达,S.Unzai公司,T.库祖亚马,高木先生,T.Terada公司,M.Shirouzu先生,横山由纪夫,J.R.H.塔姆和S.-Y.公园

嗜热细菌合成类异戊二烯非甲羟戊酸途径中一种酶的结构嗜热菌已在有衬底和衬底类似物的情况下解决了高分辨率问题。

PDB参考:本机MECDP，1iv1;SeMet MECDP与CDP-ME，1iv2;含镁的SeMet MECDP，1iv3;SeMet MECDP与CDP-ME2P，1iv4

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键价法能识别蛋白质结构中的金属原子吗？

P.Müller先生,S.Köpke和G.M.谢尔德里克

钙键价和（CBVS）被认为是鉴定蛋白质结构中金属离子的一种简便方法。

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基于模板匹配和迭代片段扩展的自动主词模型构建

T.C.特威利格

介绍了一种自动化高分子主链模型的建立方法。

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通过模板匹配自动建立侧链模型和序列分配

T.C.特威利格

描述了一种自动建立大分子侧链模型和将序列与图谱对齐的方法。

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同二聚胆固醇酯酶-配体复合物在1.4的三维结构 Å分辨率

V.普列特涅夫,A.阿德拉加塔,Z.Wawrzak公司和W.Duax公司

1.4版同二聚胆固醇酯酶的光学分辨三维结构(柱状假丝酵母)在与未知配体的配合物中发现了C₂₃-细长的酶活性部位中的链脂肪酸。

PDB参考:胆固醇酯酶-配体复合物，1llf，r11lfsf

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卤化物和硫定相中反常散射子结构的定位

I.乌松,B.施密特,R.von Bülow先生,S.格里姆,冯·菲古拉（K.von Figura）,M.道特,K.R.Rajashankar公司,Z.道特和G.M.谢尔德里克

使用来自溶剂中固有硫或卤化物的异常信号对蛋白质进行定相需要确定相当数量的部分占据或弱位点的坐标。项目中实施的双空间回收方法的使用SHELXD公司为了解决MAD、SAD、SIR和SIRAS中的这种异常散射子结构，对一个先前未知的蛋白质结构进行了实验测试。

PDB参考:Man6P/IGFII受体重复序列11，1e6f，r1e6fsf;1gqb，r1gqbsf

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A-DNA十聚体d（CCCGATCGGG）的近原子分辨晶体结构：六胺钴与A-DNA的相互作用

B.拉马克里希南,C.塞卡鲁杜,B.锅和M.Sundalingam先生

1.25的A-DNA十聚体 Δ分辨率显示了钴六胺离子与DNA双工体的一种新的结合模式。热参数分析(B因子）表明，与双链中的其他核苷酸相比，参与邻接晶体堆积的核苷酸在热稳定性方面更稳定。

PDB参考:d（CCCGATCGGG），1m77，r1m77sf

NDB参考:d（CCCGATCGGG），ad0026

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的结构大肠杆菌尿苷磷酸化酶2.0 Å

F.T.伯林,R.尼克维尔,J.A.布加利诺,T.查达,A.贝克维和C.D.利马

2.0版光学分辨率晶体结构大肠杆菌尿苷磷酸化酶的结构与大肠杆菌嘌呤磷酸化酶，进一步支持了相关但功能不同的NP-I酶类成员从共同祖先进化而来的假说。

PDB参考:尿苷磷酸化酶，1lx7，r1lx7sf

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一种快速评估膜蛋白结晶中脂质：蛋白质和洗涤剂：蛋白质比率的方法

C.J.B.达科斯塔和J.E.贝恩齐格

开发了一种简单快速的红外光谱法，用于测量溶解的整体膜蛋白样品中的脂蛋白比和洗涤剂浓度。该分析工具将有助于膜蛋白的纯化和溶解，这是结晶试验的理想选择。

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原子分辨率结构菊花欧文氏菌 L（左）-天冬酰胺酶

J.卢布科夫斯基,M.道特,K.Aghaiypour公司,A.瓦洛达尔和Z.道特

晶体结构菊花 L（左）-天冬酰胺酶的精制度为1.0 奥分辨率，阐明了迄今为止在这种精度水平上研究的最大不对称单元之一的原子级细节。

PDB参考:L（左）-天冬氨酸酶，1o7j，r1o7jsf

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1.05时碳酸酐酶II的精细原子结构奥决议：质子转移化学救援的意义

D.杜达,L.戈文达萨米,M.Agbandje-McKenna先生,C.图,D.N.西尔弗曼和R.麦肯纳

使用同步辐射和CCD探测器，X射线数据在100 人类碳酸酐酶II His64Ala突变与4-甲基咪唑（4-MI）络合的K最大值为1.05 分辨率，允许完全各向异性最小二乘细化。

PDB参考:碳酸酐酶II，1moo，r1moos

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耐热木聚糖酶来自嗜热子囊菌超高分辨率（0.89 Δ）100 K和原子分辨率（1.11 奥）293 K细化到小分子精度的各向异性

R.Natesh先生,K.马尼坎丹,P.巴努穆尔蒂,维斯瓦米特拉硕士和S.Ramakumar公司

的结构金黄色葡萄球菌以原子分辨率（1.11）将木聚糖酶溶解到小分子精度奥）293 K和超高分辨率（0.89 Δ）100 K提供了对盐桥可塑性、温度依赖性变形和酶的水结构的见解，该酶属于普遍存在的TIM相关折叠。

PDB参考:木聚糖酶，1.11 结构，1i1x，r1i1xsf;0.89 结构，1i1w，r1i1wsf

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一类用于获得高相位功率重原子衍生物的新型钆配合物：用来自黄曲霉

埃·吉拉德,M.斯特尔特,P.L.阿内利,J.维卡特和R.卡恩

七种钆配合物被证明是生产用于大分子晶体学项目的重原子衍生物的优良化合物。在一系列钆衍生物晶体上成功地进行了SAD定相，该晶体由两种蛋白质组成，即鸡蛋白溶菌酶和尿酸氧化酶黄曲霉从而生成高质量的电子密度图。

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用结构基因组学方法选择酵母假想蛋白的结构

S.Eswaramoorthy公司,S.Gerchman公司,V.格拉齐亚诺,H.基西亚,F.W.Studier公司和S.斯瓦米纳坦

用MIRAS和MAD方法测定了YBL036C的晶体结构。

PDB参考:YBL036C，MIRAS结构，1b54;YBL036C，MAD结构，1ct5

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晶体信托收据适用于高分辨率中子劳厄衍射研究的阻遏物

B.V.丹尼尔斯,D.A.A.迈尔斯,V.T.福赛斯和C.L.劳森

初步中子衍射测量大肠杆菌trp阻遏物晶体表明，有可能获得DNA结合蛋白及其相关溶剂的全原子中子结构模型。

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结晶和初步X射线分析嗜酸乳杆菌内切葡聚糖酶CelA

K.埃克特,H.A.恩斯特,E.施耐德,S.Larsen公司和L.Lo Leggio先生

家族9的结晶A.嗜酸菌据报道，CelA。这些晶体不常见，因为它们不会将染料IZIT结合在母液中，并且在数周内不会溶解在蛋白质储存缓冲液或水中。收集3.0的数据集报道了Å分辨率和初始分子置换搜索。

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全RNA U的结晶和X射线衍射分析₃₉最小发夹状核酶的C突变体

V.格鲁姆-托克斯,米洛瓦诺维奇和J.E.韦德金

一种全RNA 64米发夹状核酶已结晶成适合于3.35的X射线衍射分析的形式奥分辨率。构造包含U₃₉C取代，可提高催化效率，并代表两个螺旋-环-螺旋结构域分子间对接形成的最小催化基序。给出了结晶策略和结果。

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与阿尔茨海默βA4-淀粉样前体蛋白相关的精子膜蛋白YWK-II/APPH部分胞外片段的结晶和初步晶体学分析

杨先生,B.刘,十、张,W·周,F.高,H.庞,苗族S,L·王和Z.饶

与阿尔茨海默病βA4-淀粉样前体蛋白相关的精子膜蛋白YWK-II蛋白/APPH的部分胞外片段被重新编码，表达于大肠杆菌，已结晶，并且在2.8时已收集到完整的本地数据集奥分辨率。

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异麦芽糖合成酶（PalI）的表达、结晶及初步X射线分析克雷伯菌属特殊LX3

N.李,D.张,L.-H.张和K.斯瓦米纳坦

第一次晶体学研究，2.2 与蔗糖水解和异构化有关的酶的？分辨率。

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嗜热真杆菌tRNA假尿苷55合成酶的初步X射线晶体学分析海洋热藻

J.沃特斯,C.三角帆,V.杜贝克,M.屋顶,五、史泰龙和L.德罗格曼

过度表达、纯化和结晶马里蒂玛锥虫TruB允许收集2.0版的完整数据集奥分辨率。

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GTP依赖性转录调控因子CodY的结晶枯草芽孢杆菌

E.V.布拉戈瓦,V.M.列夫迪科夫,K.塔奇卡瓦,A.L.Sonenshein先生和A.J.威尔金森

GTP反应性转录抑制因子CodY来自枯草杆菌在有配体和无配体的情况下以多种形式结晶。完整数据集为3.5 已收集间距。

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两种抗生素合成细菌酯水解酶的X射线分析：初步结果

T.R.M.巴伦兹,C.M.H.亨斯根斯,J.J.波尔德曼-蒂杰梅斯,P.A.杰克尔,E.de Vries公司,D.B.詹森和B.W.迪克斯特拉

两种微生物α-氨基酸酯水解酶获得了高质量的晶体，这两种酶在抗生素生产中具有潜在的用途。一种酶在两个空间群中结晶，其中一个空间群的单位-细胞参数非常大。

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磷酸烯醇丙酮酸盐HPr特异性的Jel44单克隆Fab片段：糖磷酸转移酶系统大肠杆菌以及Jel44-Fab片段与HPr的配合物：制备、结晶和初步晶体学分析

J.古利亚耶娃-切尔卡索娃,S.L.拉比乌克,J.S.李,E.B.Waygood公司和L.T.J.德尔巴雷

一种Jel44单克隆Fab片段大肠杆菌HPr已被纯化。Jel44 Fab碎片的晶体衍射到4.6的分辨率 Å，而Jel44-Fab片段与HPr的新型复合物的晶体衍射到2.5的分辨率 Å.

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胸腺和活化调节趋化因子（TARC）的结晶和初步X射线研究

O.A.Asojo先生,S.卡特,D.M.胡佛,C.布列格,卢西和J.卢布科夫斯基

本文描述了在三斜、六方和四方体系中合成的胸腺和活化调节趋化因子（TARC）的初步晶体学研究。

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丙二酰辅酶A脱羧酶的结晶及初步X射线晶体学分析豆科根瘤菌bv（英国）。三叶草

J.-S.Jung,D.-J.Baek先生,G.Y.Lee先生,Y.-S.金和B.-H.哦

甲酰辅酶a脱羧酶根瘤菌物种结晶。这种酶与人类同源性有30%的序列同源性。

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SseA，一种3-巯基丙酮酸硫转移酶，来自大肠杆菌：结晶和初步晶体学数据

A.角膜炎,A.鲤鱼,F.福拉尼,圣帕加尼,博洛涅西和D.博尔多

这个体内硫转移酶的作用和底物特异性一直存在很大争议。SseA，3-巯基丙酮酸：氰化物硫转移酶大肠杆菌已结晶为适合X射线晶体学研究的四方晶型。

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霍利德结分解酶Hje的结晶和初步X射线衍射研究硫矿硫化叶菌

C.L.米德尔顿,J·L·帕克,D.J.理查德,M.F.白色和C.S.债券

Holliday结分解酶Hje来自索尔法塔利沙门菌已经结晶。初步的晶体学分析表明，同源酶Hjc的二聚体排列可能存在差异。

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高温古菌中一种新型醇脱氢酶的结晶和初步X射线衍射研究薰衣草

J.E.盖伊,M.N.Isupov先生和J.A.小男孩

高温古细菌中含锌乙醇脱氢酶的晶体A.秘鲁已通过坐滴蒸发扩散技术从表达于大肠杆菌衍射达到1.5 奥分辨率。锌在两个波长的反常衍射和两倍NCS平均得到了一个可解释的电子密度图。

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人钠C末端区域结合的根素FERM结构域的结晶特性⁺/H（H）⁺-交换器调节系数

S.Terawaki公司,R.Maesaki先生,冈田克也和白岛T

获得了根蛋白FERM结构域与NHERF和NHERF2的C末端区域之间的配合物晶体。

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3-环氧化合物的结晶和初步X射线晶体学研究-曼诺-辛库糖酸胞苷酰转移酶流感嗜血杆菌

M.-J.Ku先生,H.-J.Yoon先生,H.J.Ahn先生,H.-W.金,S.-H.Baek先生和S.W.Suh先生

CMP-KDO合成酶来自流感嗜血杆菌结晶。X射线衍射数据收集到2.2 ω来自SeMet晶体。

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tRNA（m）的结晶和初步X射线晶体学分析¹G37）甲基转移酶来自流感嗜血杆菌

H.-W.金,H.J.Ahn先生,H.-J.Yoon先生,H.W.金,S.-H.Baek先生和S.W.Suh先生

tRNA（米¹G37）甲基转移酶（TrmD）流感嗜血杆菌结晶了。X射线数据已收集到1.85 Å.

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T7RNA聚合酶延伸复合物的结晶和初步晶体学分析

D.特米亚科夫,T.H.塔希罗夫,M.阿尼金,W.T.麦卡利斯特,D.G.Vassylyev（D.G.瓦西里耶夫）和横山由纪夫

噬菌体T7 RNA聚合酶延伸复合物含有8 RNA–DNA杂交的bp和10 下游DNA的bp，总分子量为～110 kDa结晶。2.6收集了完整的衍射数据集奥分辨率。结构确定和细化正在进行中。

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一种新修饰的3-氯邻苯二酚1,2-二加氧酶的初步晶体学分析正交的-来自革兰氏阳性菌的途径红球菌在2-氯苯酚上生长的1CP

M.费拉罗尼,M.Y.Ruiz Tarifa先生,A.斯科扎法瓦,I.P.索利亚尼科娃,M.P.Kolomytseva先生,L.戈洛夫列娃和F.布里甘蒂

革兰氏阳性菌3-氯邻苯二酚1,2-二加氧酶奥帕库斯红腹滨鹬1CP是一种参与3-氯邻苯二酚（2-氯苯酚好氧生物降解的中间产物）特异性裂解的酶，现已结晶。

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PP2C型磷酸酶RsbU激酶重组域的结晶和初步晶体学分析

S.Dutta（圣杜塔）和R.J.刘易斯

PP2C型磷酸酶RsbU的激酶重组域枯草杆菌以衍射至1.6的形式结晶 Å分辨率。

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双液体系在液滴蒸发扩散蛋白质结晶中的应用

H.阿达奇,K.Takano公司,森川先生,S.卡纳亚,吉村先生,Y.Mori先生和佐佐木（T.Sasaki）

提出了一种新的蛋白质结晶方法——浮滴气相扩散技术。

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2003年作者笔记

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