AFGen:基于片段的化合物描述符

当前版本:2.0.0,5/12/2008

AFGen是一个程序,它将一组化合物作为输入,并基于它们包含的基于碎片的描述符集生成它们的向量空间表示。描述符空间由图片段组成,图片段可以具有三种不同类型的拓扑:路径(PF)、非循环子图(AF)和任意拓扑子图(GF)。这种基于向量的表示可以用于化学信息学中的不同任务,包括相似性搜索、虚拟筛选和库设计。

这些描述符在捕获化合物的结构特征方面非常有效。在基于SVM的分类和等级检索环境下的实验表明,这些描述符在统计上始终优于以前基于广泛使用的指纹和Maccs密钥描述符开发的方案,以及最近引入的通过挖掘和分析分子图结构获得的描述符。