注释类型和源

Annotations平台承载来自不同提供者的注释，涵盖不同的注释类型（例如命名实体和关系）。下表列出了注释的类型和相应的提供程序。

如果您是一个文本挖掘组，并且可以以我们要求的格式提供注释，请阅读在这里

JSON-LD注释格式

本段描述了以JSON-LD形式提供注释数据的详细信息。JSON-LD（用于链接数据的JSON）是JSON的一个变体，可以链接来自不同资源的数据。有关JSON-LD的更多详细信息，请参阅以下链接：JSON-LD定义和JSON-LD语法.

注释在Web注释数据模型（OA）中建模。有关OA模型的更多详细信息，请参阅以下链接：OA定义和OA词汇.

要将注释表示为JSON-LD，必须提供上下文（由JSON-LD中的关键字@context表示）。上下文允许应用程序解释正在交换的数据（使用一组链接到指定词汇表和本体中各种术语的URI）。对于Annotation API，可以找到上下文文件在这里.

根据注释的类型，有不同类型的JSON-LD表示：

• 命名实体注释（即由欧洲PMC提供）

  {“@context”：“http://europepmc.org/docs/europepcmc-annotation-api-vocab.json“，#上下文文件“id”：“http://europepmc.org/article/MED/21494379#europepcmc_1-1“，#注释链接背面“type”：“注释”，“创建者”：“europepemc”，#provider“主体”：“http://purl.obolibrary.org/obo/CHEBI_29228“，标记的数据库实体的#uri“目标”：{“id”：“http://europepmc.org/article/MED/21494379#europepcmc_1-1“，#注释链接背面“源”：“http://europepmc.org/article/MED/21494379“，#文章页面url“isPartOf”：“标题”，文章中注释出现的#部分“选择器”：{“type”：“TextQuoteSelector”，“确切”：“氟化物”，#文章内注释文本“prefix”：“”，文章中注释的#前缀“后缀”：“某些发酵品牌的浓度”#文章内部注释的后缀      }   }}

• 基于句子的注释（即由HES-SO/SIB针对Elixir、NaCTeM、IntAct的文本挖掘提供）

  {“@context”：“http://europepmc.org/docs/europepcmc-annotation-api-vocab.json“，#上下文文件“id”：“http://europepmc.org/abstract/MED/15892892#geneRif_356408_P36159“，#注释链接返回“type”：“注释”，“creator”：“HES-SO/SIB Elixir文本挖掘”，#provider“目标”：“http://purl.uniprot.org/uniprot/P36159“，标记的数据库实体的#uri“主体”：{“id”：“http://europepmc.org/abstract/MED/15892892#geneRif_356408_P36159“，#注释链接返回“type”：“TextualBody”，“value”：“在这项工作中，我们表明由TRZ1（tRNase Z1）编码的ELAC2的酵母同源物在基因上参与RNA处理。”，#文章内注释的文本“源”：“http://europepmc.org/article/MED/15892892“，#文章页面url“isPartOf”：文章中注释出现的“Abstract”#部分   }}

• 包含基因-疾病关系的注释（即由Open Targets Platform和DisGeNET提供）

  {“@context”：“http://europepmc.org/docs/europepcmc-annotation-api-vocab.json“，#上下文文件“id”：“http://europepmc.org/articles/PMC3691765#openTargets_1563_Q14790_EFO_0001668“，#注释链接返回“type”：“注释”，“creator”：“OpenTargets”，#provider“目标”：{“type”：“列表”，“项目”：[｛”id“：”http://purl.uniprot.org/uniprot/Q14790“，”label“：”caspase 8“}，{”id“：”http://www.ebi.ac.uk/efo/efo_0001668“，”label“：”HPV“}]#uri标记的数据库实体   },“主体”：{“id”：“http://europepmc.org/articles/PMC3691765#openTargets_1563_Q14790_EFO_0001668“，#注释链接返回“type”：“TextualBody”，“value”：“caspase 8（HPV）”，#文章内注释的文本“源”：“http://europepmc.org/articles/PMC3691765“，#文章页面url出现注释的文章的“isPartOf”：“Table”#部分   }}