对于LUMIER测定,蛋白质在HEK-293细胞中瞬时表达为与金黄色葡萄球菌蛋白质A标签或动物海肾萤光素酶与所指示的末端融合。使用0.05μl Lipofectamine 2000(Invitrogen)将每个表达构建物共20 ng转染到10000个HEK293细胞中。40小时后,取出培养基,并在10μl冰冷裂解缓冲液中将细胞溶解在冰上[20 mM Tris-HCl,pH 7.5,250 mM NaCl,1%Triton X-100,10 mM EDTA,10 mM-二硫苏糖醇(DTT),蛋白酶抑制剂鸡尾酒(Roche),磷酸酶抑制剂鸡尾液(罗氏),100单位/μl苯甲酸酶(最终浓度)(Novagen)]含有羊抗(兔IgG)涂层磁珠(Invitrogen;Dynabeads M280,最终浓度2 mg/ml)。然后将裂解液在冰上培养15分钟。接下来,在每个孔中添加100μl洗涤缓冲液(PBS和1 mM DTT),并在洗涤之前去除10%的稀释裂解液以测定每个样品中存在的荧光素酶活性。其余样品在Tecan Hydroflex洗板机的洗涤缓冲液中洗涤六次。测定裂解液和洗涤珠中的荧光素酶活性。阴性对照组转染表达各自荧光素酶融合蛋白的质粒和表达蛋白a二聚体而非蛋白a融合蛋白的载体。对于每个样品,测量了四个值:洗涤(输入)前10%样品中的荧光素酶,洗涤(绑定)后珠子上的荧光素酶活性,以及阴性对照(输入nc和绑定nc)的相同值。归一化交互信号的计算如下:log(bound)/log(input)–log(bind-nc)/log(input nc)。标准化交互信号为z(z)-通过减去平均值并除以标准偏差进行转换。平均值和标准偏差是从预期不会相互作用的蛋白质对的大数据集(即从阴性参考集)中计算出来的。