寡核苷酸的准确性和精密度研究阵列：在大浓度下提取更多信号

动机：尽管成功和受欢迎寡核苷酸阵列作为高通量mRNA检测技术到目前为止，表达水平、定量校准研究有限。主要原因是没有合适的数据。然而，Affymetrix最近生成的校准数据现在允许详细说明强度相关灵敏度的研究。给出特定的成绩单浓度，了解电流分析方法能够检测2或更高。

结果：使用校准数据，我们证明当前技术能够检测变化在低至中浓度范围内，情况明显恶化用于高浓度。在这种情况下，表达变化高达4褶皱严重偏斜，2的变化往往无法检测到。这样的影响主要是序列特定绑定的结果探针的性质，而不是光学饱和的结果荧光测量。基因芯片的制造方式是转录本由一组亲和力范围很广的序列探测。我们表明此属性可用于设计能够减少高强度偏差。我们方法背后的想法是将具有最佳线性响应的探针子集的测量权重在给定浓度下，可以使用局部嵌入实现技术。

可用性：程序源代码将根据要求以电子方式发送。

联系人：felix@funes.rockefeller.edu