监测:流行病的时空建模与监测现象

时间序列建模与监测的统计方法计数,比例和分类数据,以及建模流行病现象的连续时间点过程。监测方法主要集中在计数数据时间的像差检测上传染病公共卫生监测系列,但是应用程序也可以来源于environmetrics,可靠性工程、计量经济学或社会科学。包裹实施许多典型的暴发检测程序,如(改进)法林顿算法,或负二项GLR-CUSUMHöhle和Paul方法(2008)<doi:10.1016/j.csda。2008年2月15日>.一种结合logistic和多项式logistic的CUSUM方法模型也包括在内。这个包包含几个真实世界的数据集合,模拟爆发数据的能力,以及可视化时间、空间或时空的监测结果时尚。最近对可用监控程序的概述是Salmon等人(2016年)<doi:10.18637/jss。v070。i10号>.对于流行病传播的回顾性分析,该包提供三个地方病流行模型框架和可视化工具,似然推理和模拟。hh4()估计模型(多变量)统计保罗和霍尔德(2011)之后的时间序列<模拟码:1002.10。4177>Meyer和Hold(2014年)<doi:10.1214/14-AOAS743>.twinSIR()模拟易感传染病恢复(SIR)事件固定人口的历史,例如农场或网络的流行病,Höhle(2009)提出的多元点过程<doi:10.1002/bimj。200900050>.twinstim()估计自激点感染事件时空点模式的过程模型,e、 g.时间戳地理参考监测数据,由Meyer等人(2012年)<doi:10.1111/j.1541-0420.2011.01684。>.最近对已实现的时空建模框架的概述因为流行现象由Meyer等人(2017)给出<doi:10.18637/jss。v077。十一>.

版本: 1.19.1款
取决于: R(3.6.0),方法,grDevices,graphics,stats,utils,服务提供商(1.0-15),X表(1.7-0)
进口: Rcpp公司(0.11.1条),聚碳酸酯(0.8.0),质量,矩阵,nlme公司,斯帕斯塔特。geom公司,斯帕斯塔特(2.0条)
链接到: Rcpp公司,聚碳酸酯
建议: 平行,网格,额外网格(2.0.0段),格子,色彩空间,规模,动画,msm公司,统计过程控制,二次规划优化函数,回忆录,多晶硅,rgeos公司,gpclib公司,地图工具,间隔,spdep公司,努姆德里夫,马克斯利克,gsl公司,扇形图,HHH4联系人,tinytest公司(1.2.4条),尾声,苏丹人民解放军,形状的广义可加模型,英拉,runjags公司,MGLM公司(0.1.0),
增强: xts公司,GG地块2
出版: 2021年3月31日
作者: 迈克尔·赫勒兽人iD[aut,ths],塞巴斯蒂安·梅耶兽人iD[aut,cre],迈克尔·保罗[aut],莱昂哈德控股[ctb,ths],霍华德·伯科姆[ctb],泰国科雷亚[ctb],马蒂亚斯·霍夫曼[ctb],克里斯蒂安·朗[ctb],朱利安曼尼茨[ctb],安德烈·里布勒[ctb],Daniel Sabanés Bové[ctb],Maëlle鲑鱼[ctb],德克舒马赫[ctb],斯特凡·施泰纳(Stefan Steiner)[ctb],米科·维塔宁[ctb],魏伟[ctb],瓦伦丁威默[ctb],R核心团队[ctb](一些代码段是代码的修改版本从底部R)
维护人员: 塞巴斯蒂安·迈耶<seb。梅耶在fau。数据元素>
许可证: GPL-2
网址: https://surveillance.R-Forge.R-project.org/
需求对比:
其他存储库: https://insa.r-inla-download.org/r/stable/
引用: 监控引用信息
材料: 新闻
在视图中: 环境测量学,时空的,时间序列
起重机检查: 监测结果

文档:

参考手册: 监控。pdf格式
渐晕: 阿尔戈。glrnb:使用广义似然比统计量的计数数据回归图
hh4:传染病计数的地方流行病模型框架
R中监测计数时间序列:公共卫生监测中的畸变检测
爆发检测入门
hhh4(时空):区域统计时间序列的地方病流行模型
twinSIR:具有已知距离的固定人群的个体水平流行病模型
twinstim:一个用于时空点模式的地方病流行模型框架

下载:

包源: 监控_1.19.1。焦油。广州
Windows二进制文件: r-devel公司:监控_1.19.1。拉链,r-devel-UCRT:监控_1.19.1。拉链,r-释放:监控_1.19.1。拉链,r-oldrel:监控_1.19.1。拉链
MacBinaries系统: r型释放装置(arm64):监控_1.19.1。tgz公司,r-release(x86\u 64):监控_1.19.1。tgz公司,r-oldrel:监控_1.19.1。tgz公司
老资料来源: 监控档案

反向依赖关系:

反转取决于: HHH4联系人
反向导入: 上位信号
反面建议: BSBT公司,t计数

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