sumFREGAT:基于汇总统计的快速区域关联测试
基于区域/基因的经典关联分析的改进使用汇总统计的技巧(P值和效应大小)以及作为输入的遗传变异之间的相关性。它是一种执行工具使用全基因组结果的最流行和最有效的基于基因的测试没有原始基因型和现有表型。有关详细信息,请参阅:Svishcheva等人(2019)使用GWAS摘要进行基于基因的关联测试统计数据。生物信息学。Belonogova等人(2022)SumSTAAR:基于基因的灵活框架使用GWAS汇总统计数据进行关联研究。PLOS Comp生物。
版本: |
1.2.5 |
取决于: |
R(≥3.0.0) |
进口: |
方法,矩阵、花键、,序列矿工,GBJ公司 |
建议: |
数据表 |
出版: |
2022-06-07 |
作者: |
Nadezhda M.Belonogova和古尔纳拉·斯维舍娃捐款来自:Seunggeun Lee(内核函数),Pierre Lafaye de Michoaux(“戴维斯”方法),托马斯·卢姆利(“kuonen”方法),王明辉,刘一元,韩世忠(simpleM函数),刘耀武(ACAT功能),James O.Ramsay(功能数据分析功能),Xihao Li、Zilin Li和Han Chen(STAAR程序的概念) |
维护人员: |
Nadezhda M.Belonogova<belon at bionet.nsc.ru> |
许可证: |
GPL-3公司 |
需要编译: |
是的 |
材料: |
更改日志 |
CRAN检查: |
sumFREGAT结果 |
文档:
下载内容:
链接:
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