spatstat:空间点模式分析、模型拟合、仿真、测试

用于分析空间点模式的综合开源工具箱。主要关注二维点模式,包括任何空间区域中的多类型/标记点。还支持三维点模式、任意维的时空点模式、线性网络上的点模式以及其他几何对象的模式。支持空间协变量数据,如像素图像。包含3000多个功能,用于绘制空间数据、探索性数据分析、模型拟合、模拟、空间采样、模型诊断和形式推理。数据类型包括点模式、线段模式、空间窗口、像素图像、镶嵌和线性网络。探索性方法包括样方计数、K函数及其模拟包络、最近邻距离和空域统计、Fry图、对相关函数、核平滑强度、具有交叉验证带宽选择的相对风险估计、标记相关函数、分离指数、,标记依赖诊断和协变量效应的核估计。还支持随机模式的正式假设测试(奇方、科尔莫戈罗夫·斯米尔诺夫、蒙特卡罗、Diggle-Cresse-Loosmore-Ford、道根、两阶段蒙特卡罗)和协变量效应的测试(考克斯-伯曼-沃勒-劳森、科尔莫哥罗夫·史米尔诺夫·ANOVA)。参数模型可以使用类似于glm()的函数ppm()、kppm()、slrm()、dppm()来拟合点模式数据。模型类型包括泊松点过程、吉布斯点过程和考克斯点过程、内曼-斯科特簇过程和行列式点过程。模型可能涉及对协变量的依赖、点间相互作用、簇形成和标记的依赖。模型采用最大似然法、逻辑回归法、最小对比法和复合似然法进行拟合。可以使用函数mppm()将模型拟合到点模式列表(复制的点模式数据)。根据实验设计,除了上述所有特征外,该模型还可以包括随机效应和固定效应。拟合点过程模型可以自动模拟。支持拟合模型的形式假设检验(似然比检验、偏差分析、蒙特卡罗检验)以及模型选择的基本工具(逐步()、AIC())和变量选择(sdr)。用于验证拟合模型的工具包括仿真包络线、残差、残差图和Q-Q图、杠杆和影响诊断、部分残差和添加的变量图。

版本: 3.0-8
取决于: R(≥3.5.0),spastat.data数据(≥ 3.0-4),spatstat.geom公司(≥3.2-9),spatstat.随机(≥ 3.2-3),spastat.explore软件(≥3.2-7),spastat.模型(≥ 3.2-11),spastat.linnet公司(≥3.1-5),utils
进口: spatstat.utils软件(≥ 3.0-4)
出版: 2024-03-26
作者: 阿德里安·巴德利ORCID标识[aut,cre],罗尔夫·特纳ORCID标识[aut],埃格·鲁巴克ORCID标识[自动]
维护人员: 阿德里安·巴德利。巴德利在curtin.edu.au>
错误报告: https://github.com/spatstat/spatstat/issues
许可证: GPL-2型|GPL-3公司[扩展自:GPL(≥2)]
网址: http://spatstat.org/
需要编译:
引用: spatstat引用信息
材料: 新闻
在视图中: 空间,时空,生存
CRAN检查: spatstat结果

文档:

参考手册: spatstat.pdf软件
渐晕图: Spatstat中修复的错误
为Spatstat包提供的数据集
Spatstat中函数对象指南
Spatstat入门
分析Spatstat中的复制点模式
处理spatstat包中的形状文件
Spatstat系列的最新更新摘要

下载内容:

包源: spastat_3.0-8.tar.gz
Windows二进制文件: r-预发布:spatstat_3.0-8.zip,r版本:spatstat_3.0-8.zip,r-oldrel:spatstat_3.0-8.zip
macOS二进制文件: r-prerel(arm64):溅射_3.0-8.tgz,r-release(arm64):spastat_3.0-8.tgz,r-oldrel(arm64):spastat_3.0-8.tgz,r-prerel(x86_64):spastat_3.0-8.tgz,r-release(x86_64):spastat_3.0-8.tgz
旧来源: spatstat存档

反向依赖关系:

反向取决于: 富裕指数,CalSim公司,狄克逊,欧洲经委会,国际开发协会,间隙共变,lm代表,ppmlasso公司,复制pp2w,选择spm,siplab公司,翼梁,空间熵,空间Vx,spastat.gui软件,斯帕斯塔特。膝盖,spatstat.局部,stlnpp公司,ttbary公司
反向进口: 自适应FMRI,binspp公司,DRHotNet,厄瓜多尔,g胶片,gfilogisreg公司,高风险区,lsirm12pl型,NTSS公司,rcarbon公司,RImageJROI公司,ROCn记录
反向建议: 原始数据,竹竿,epiR公司,强度网,集成SDM,综合产品数据仓库,ipsecr公司,接通,接通,萨格R,,平方英尺,沙尔,spastat.explore软件,spatstat.geom公司,spastat.linnet公司,spastat.模型,spatstat.随机,星星,轨迹

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