速率矩阵:进化速率矩阵的贝叶斯估计

进化速率矩阵是一个方差-协方差矩阵,它描述了性状进化的速率和多种性状之间的进化相关性。该软件包具有使用贝叶斯MCMC估计这些参数的功能。在沿着系统发育树的分支绘制的预测体系之间,可以测试性状之间的进化相关性模式是否发生了变化。根据联合估算方法,可以先验地创建或估算机制,作为MCMC的一部分。该软件包具有运行MCMC链、绘制结果、评估收敛性和总结后验分布的功能。

版本: 1.2.4
取决于: R(≥3.5.0)
进口: ,盖革,尾波,公司,MASS(质量),藻门,阅读器,mvMORPH公司,卢比,椭圆
链接到: 卢比,RcppArmadillo公司
建议: 针织物,rmarkdown公司,植物醇,降价
出版: 2022-06-03
作者: 丹尼尔·卡塔诺,卢克·哈蒙
维护人员: 丹尼尔·卡塔诺(Daniel Caetano)<caetanods1 at gmail.com>
许可证: GPL-2型|GPL-3型[扩展自:GPL(≥2.0)]
网址: https://github.com/Caetanods/ratematrix网站
需要编译:
CRAN检查: 比率矩阵结果

文档:

参考手册: 速率矩阵.pdf
渐晕图: 费率矩阵简介
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下载内容:

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Windows二进制文件: r-预发布:费率矩阵_1.2.4.zip,r版本:费率矩阵_1.2.4.zip,r-oldrel:费率矩阵_1.2.4.zip
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旧来源: 速率矩阵存档

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