polysat:多倍体微卫星分析工具

处理微型卫星数据的工具集合任何等位基因拷贝数不为已知存在部分杂合基因型。它可以在中导入和导出数据ABI“基因映射器”、“结构”、“ATetra”、“Tetrasat”/“Tetra”、“GenoDive”、“SPAGeDi”、,“POPDIST”、“STRand”和二进制存在/缺失格式。它可以计算使用逐步突变模型或无限等位基因模型,带或不带多态性和等位基因频率考虑在内。这些距离可用于计算克隆多样性统计或用于R.等位基因多样性的进一步分析统计和多态信息内容也可用。聚硫罐帮助用户估计样本的倍性,它可以估计等位基因人群中的频率,计算成对或全球差异统计并将等位基因频率输出到“SPAGeDi”和“adegenet”。还包括在一对等位基因的情况下将等位基因分配给isoloci的功能微卫星引物扩增两个或多个独立的等位基因分离isoloci。Clark和Jasieniuk(2011)描述了多聚脂肪<doi:10.1111/j.1755-0998.2011.02985.x>以及Clark和Schreier(2017年)<doi:10.1111/1755-0998.12639>.

版本: 1.7-7
进口: methods、stats、utils、grDevices、graphics、,卢比
链接到: 卢比
建议: ade4(ade4),阿德根特,
出版: 2022-08-23
作者: 林赛·V·克拉克ORCID标识[aut,cre],阿利斯泰尔·霍尔ORCID标识【ctb】,Handunnethi Nihal de Silva【ctb】,泰勒·威廉·史密斯ORCID标识【ctb】
维护人员: 林赛·V·克拉克。克拉克在西雅图儿童网>
许可证: GPL-2型
网址: https://github.com/lvclark/polysat/wiki网站
需要编译:
引用: 多卫星引文信息
材料: 新闻
CRAN检查: 多卫星结果

文档:

参考手册: 多卫星.pdf
渐晕图: 在polysat中为isoloci指定等位基因
polysat 1.7版教程手册

下载内容:

包源: 多卫星_1.7-7.tar.gz
Windows二进制文件: r-devel公司:聚酯纤维_1.7-7.zip,r版本:聚酯纤维_1.7-7.zip,r-oldrel:聚酯纤维_1.7-7.zip
macOS二进制文件: r释放(arm64):多卫星_1.7-7.tgz,r-oldrel(arm64):多卫星_1.7-7.tgz,r-版本(x86_64):多糖_1.7-7.tgz
旧来源: polysat档案

反向依赖关系:

反向进口: 爆裂声

链接:

请使用规范形式https://CRAN.R-project.org/package=polysat链接到此页面。