polysat:多倍体微卫星分析工具
处理微型卫星数据的工具集合任何等位基因拷贝数不为已知存在部分杂合基因型。它可以在中导入和导出数据ABI“基因映射器”、“结构”、“ATetra”、“Tetrasat”/“Tetra”、“GenoDive”、“SPAGeDi”、,“POPDIST”、“STRand”和二进制存在/缺失格式。它可以计算使用逐步突变模型或无限等位基因模型,带或不带多态性和等位基因频率考虑在内。这些距离可用于计算克隆多样性统计或用于R.等位基因多样性的进一步分析统计和多态信息内容也可用。聚硫罐帮助用户估计样本的倍性,它可以估计等位基因人群中的频率,计算成对或全球差异统计并将等位基因频率输出到“SPAGeDi”和“adegenet”。还包括在一对等位基因的情况下将等位基因分配给isoloci的功能微卫星引物扩增两个或多个独立的等位基因分离isoloci。Clark和Jasieniuk(2011)描述了多聚脂肪<doi:10.1111/j.1755-0998.2011.02985.x>以及Clark和Schreier(2017年)<doi:10.1111/1755-0998.12639>.
文档:
下载内容:
反向依赖关系:
链接:
请使用规范形式https://CRAN.R-project.org/package=polysat链接到此页面。