polyRAD：来自测序数据的不确定性基因型调用多倍体和二倍体
从基因分型测序（GBS）或限制中读取深度数据导入位点相关DNA测序（RAD-seq）并用于制作贝叶斯多倍体或二倍体基因型的概率估计。基因型概率、后验平均基因型或最可能的基因型导出以进行下游分析。”克拉克等人（Clark et al。(2019) <doi:10.1534/g3.118.200913>，以及标记的Hind/He统计Clark等人描述了滤波。（2022）<doi:10.1186/s12859-022-04635-9>.还包括用于高度重复基因组的变体调用管道由Clark等人描述（2020年，第1版）<数字对象标识代码：10.1101/2020.011.902890>.
| 版本： |
2.0.0 |
| 取决于： |
R（≥3.5.0），方法 |
| 进口： |
快速比赛,pca方法,卢比,斯特林吉 |
| 链接到： |
卢比 |
| 建议： |
rrBLUP公司,Rsamtools软件,基因组信息Db,生物串,基因组范围,变量注释,总结性实验,S4载体,I范围,生物遗传学,针织物,rmarkdown公司,基因组特征,ggplot2,阿德根特 |
| 出版： |
2022-11-06 |
| 作者： |
林赛·V·克拉克 [aut，cre]，美国国家科学基金会 |
| 维护人员： |
林赛·V·克拉克。克拉克在西雅图儿童网> |
| 许可证： |
GPL-2型|GPL-3公司[扩展自：GPL（≥2）] |
| 网址： |
https://github.com/lvclark/polyRAD |
| 需要编译： |
是的 |
| 引用： |
polyRAD引文信息 |
| 材料： |
新闻 |
| CRAN检查： |
polyRAD结果 |
文档：
下载内容：
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链接：
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