nanostringr:执行质量控制、数据规范化和批处理效果“NanoString n计数器”数据的修正
提供质量控制(QC)、规范化和批处理“NanoString nCounter”数据的效果校正操作,Talhouk等(2016)<doi:10.1371/journal.pone.0153844>。各种指标包括用于确定哪些样品通过或未通过质量控制。基因表达应该首先将其归一化为家政基因,然后使用基于参考的方法来调整批处理效果。原始NanoString数据可以以Reporter Code Count的形式导入(RCC)文件。
版本: |
0.4.1 |
取决于: |
R(≥3.5.0) |
进口: |
断言,ccaPP公司,dplyr公司,呜呜声,爱尔兰航空公司,第三年 |
建议: |
覆盖(covr),针织物,马格里特,市场营销,测试那个 |
出版: |
2023-08-15 |
作者: |
德里克·邱[自动,cre],阿琳·塔尔胡克[aut],梁朝伟(Samuel Leung)[自动] |
维护人员: |
Derek Chiu<bccrc.ca的dchiu> |
错误报告: |
https://github.com/TalhoukLab/nanostringr/issues |
许可证: |
麻省理工学院+文件许可证 |
网址: |
https://github.com/TalhoukLab/nanostringr/,https://talhouklab.github.io/nanostringr/ |
需要编译: |
不 |
引用: |
nanostringr引文信息 |
材料: |
新闻 |
在视图中: |
组学 |
CRAN检查: |
纳米字符串结果 |
文档:
下载内容:
链接:
请使用规范形式https://CRAN.R-project.org/package=nanostringr链接到此页面。