nanostringr:执行质量控制、数据规范化和批处理效果“NanoString n计数器”数据的修正

提供质量控制(QC)、规范化和批处理“NanoString nCounter”数据的效果校正操作,Talhouk等(2016)<doi:10.1371/journal.pone.0153844>。各种指标包括用于确定哪些样品通过或未通过质量控制。基因表达应该首先将其归一化为家政基因,然后使用基于参考的方法来调整批处理效果。原始NanoString数据可以以Reporter Code Count的形式导入(RCC)文件。

版本: 0.4.1
取决于: R(≥3.5.0)
进口: 断言,ccaPP公司,dplyr公司,呜呜声,爱尔兰航空公司,第三年
建议: 覆盖(covr),针织物,马格里特,市场营销,测试那个
出版: 2023-08-15
作者: 德里克·邱ORCID标识[自动,cre],阿琳·塔尔胡克ORCID标识[aut],梁朝伟(Samuel Leung)ORCID标识[自动]
维护人员: Derek Chiu<bccrc.ca的dchiu>
错误报告: https://github.com/TalhoukLab/nanostringr/issues
许可证: 麻省理工学院+文件许可证
网址: https://github.com/TalhoukLab/nanostringr/,https://talhouklab.github.io/nanostringr/
需要编译:
引用: nanostringr引文信息
材料: 新闻
在视图中: 组学
CRAN检查: 纳米字符串结果

文档:

参考手册: 纳米线.pdf
渐晕图: nanostringr封装

下载内容:

包源: 纳米字符串0.4.1.tar.gz
Windows二进制文件: r-预发布:纳米字符串0.4.1.zip,r版本:纳米字符串0.4.1.zip,r-oldrel:纳米字符串0.4.1.zip
macOS二进制文件: r-prerel(arm64):纳米线0.4.1.tgz,r-release(arm64):纳米线0.4.1.tgz,r-oldrel(臂64):纳米线0.4.1.tgz,r-prerel(x86_64):纳米线0.4.1.tgz,r-release(x86_64):纳米线0.4.1.tgz
旧来源: nanostringr档案

链接:

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