myTAI:进化转录组学

通过捕获转录组中的进化特征来研究生物过程的进化(Drost等人(2017))<doi:10.1093/bioinformatics/btx835>). 该工具的目的是提供一个转录组分析环境,以量化有助于感兴趣转录组的基因的平均进化年龄(Drost等人(2016))<数字对象标识代码:10.1101/051565>).

版本: 0.9.3
取决于: R(≥3.1.1)
进口: 卢比(≥ 0.12.0),北欧(≥1.0-2),菲迪斯特普卢斯(≥1.0-2),平行(≥3.1.1),foreach公司(≥ 1.4.2),do并行(≥ 1.0.8),dplyr公司(≥ 0.3.0),R彩色啤酒(≥ 1.1-2),征税(≥0.6.0)、方法(≥3.1.1)、图形,重塑2(≥ 1.4.1),ggplot2(≥ 1.0.1),阅读器(≥ 0.2.2),易怒的比例尺额外网格边缘R
链接到: 卢比RcppArmadillo公司cpp11型
建议: 针织物(≥ 1.6),rmarkdown公司(≥ 0.3.3),开发工具(≥ 1.6.1),测试那个(≥0.9.1),mgcv公司
出版: 2021-02-24
作者: 哈伊克·乔治·德罗斯特ORCID标识[aut,cre]
维护人员: 哈伊克·乔治·德罗斯特(Hajk-Georg Drost)<Hajk-Georg.Drost at tuebingen.mpg.de>
错误报告: https://github.com/drostlab/myTAI/issues网站
许可证: GPL-3公司
网址: https://github.com/drostlab/myTAI网站
需要编译: 是的
系统要求: C++11
引用: myTAI引文信息
材料: 自述文件 新闻
CRAN检查: myTAI结果

文档:

参考手册: 我的TAI.pdf
渐晕图: 高级植物基因组学分析
富集分析
用“myTAI”进行基因表达分析
中间系统发育转录组学分析
myTAI包简介
检索分类信息

下载内容:

程序包来源: 我的TAI_0.9.3.tar.gz
Windows二进制文件: r-devel公司:myTAI_0.9.3.zip,r版本:myTAI_0.9.3.zip,r-oldrel:myTAI_0.9.3.zip
macOS二进制文件: r释放(arm64):我的TAI_0.9.3.tgz,r-oldrel(arm64):我的TAI_0.9.3.tgz,r-release(x86_64):我的TAI_0.9.3.tgz
旧来源: myTAI存档

链接:

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