mutSignatures：解读体细胞突变目录中的突变特征

由于DNA损伤和DNA修复过程，癌细胞积累DNA突变。这个计算框架旨在破译癌症中的DNA突变特征。该框架包括支持原始数据导入和处理、变异特征提取以及结果解释和可视化的模块。该框架接受广泛使用的存储DNA变体信息的文件格式，例如Variant Call Format文件。该框架执行非负矩阵分解以提取突变特征，解释观察到的DNA突变集。引导是分析的一部分。该框架支持并行化，并针对多核系统进行了优化。Fantini D等人（2020年）对该软件进行了描述<doi:10.1038/s41598-020-75062-0>并且基于Alexandrov LB等人（2013）对原始MATLAB WTSI框架的基于R的自定义实现<doi:10.1016/j.celrep.2012.12.008>.

版本：	2.1.1
取决于：	R（≥3.5），foreach公司
进口：	图形、统计、，集群,do并行,ggplot2,普拉克马,代理，方法
建议：	数字播放器,重塑2,kableExtra（额外）,额外网格,针织物,rmarkdown公司
出版：	2020-11-09
作者：	达米亚诺·范蒂尼、瓦妮娅·维迪马尔、约书亚·J·米克斯
维护人员：	达米亚诺·范蒂尼
许可证：	GPL-2型
网址：	https://www.data-pulse.com/dev_site/mutsignatures网站/
需要编译：	不
引用：	mutSignatures引用信息
在视图中：	组学
CRAN检查：	mutSignatures结果

文档：

参考手册：	mutSignatures.pdf
渐晕图：	mutSignatures入门

下载内容：

包源：	多重签名_2.1.1.tar.gz
Windows二进制文件：	r-预发布：mutSignatures_2.1.1.zip，r版本：多个签名_2.1.1.zip，r-oldrel：mutSignatures_2.1.1.zip
macOS二进制文件：	r-prerel（arm64）：mutSignatures_2.1.1.tgz，r-release（arm64）：mutSignatures_2.1.1.tgz，r-oldrel（arm64）：mutSignatures_2.1.1.tgz，r-prerel（x86_64）：mutSignatures_2.1.1.tgz，r-release（x86_64）：mutSignatures_2.1.1.tgz
旧来源：	mutSignatures存档

链接：

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