mixKernel:使用内核方法的Omics数据集成

基于内核的方法是强大的集成方法异构数据类型。mixKernel旨在提供组合方法用于无监督探索性分析的内核。不同的解决方案是提供用于以一致的方式或以以下方式计算元内核最佳保存数据的原始拓扑。mixKernel还集成了在非线性空间中可视化样本之间相似性的核PCA从多来源的角度来看<doi:10.1093/bioinformatics/btx682>. 选择方法(以及显示)重要变量<doi:10.1093/nargab/lqac014>.

版本: 0.9-1
取决于: R(≥3.5.0),mixOmics公司,ggplot2,网状的(≥ 1.14)
进口: 素食主义者,品学兼优,校正图,心理,二次规划优化函数,LDR工具,矩阵、方法、,降价
建议: rmarkdown公司,针织物
出版: 2024年1月27日
作者: Nathalie Vialaneix【aut,cre】,Celine Brouard[aut],雷米·弗拉马利[aut],朱利安·亨利,杰罗姆·马里特
维护人员: Nathalie Vialaneix<nathali.Vialaneix at inrae.fr>
错误报告: https://forgemia.ira.fr/genotoul-bioinfo/mixKernel/-/issues
许可证: GPL-2型|GPL-3公司[扩展自:GPL(≥2)]
网址: http://mixkernel.clementine.wf
需要编译:
引用: mixKernel引用信息
材料: 新闻
CRAN检查: mixKernel结果

文档:

参考手册: mixKernel.pdf格式
渐晕图: 安装说明
使用mixKernel进行综合探索性分析

下载内容:

包源: 混合内核_0.9-1.tar.gz
Windows二进制文件: r-预卷:mixKernel_0.9-1.zip,r版本:mixKernel_0.9-1.zip,r-oldrel:mixKernel_0.9-1.zip
macOS二进制文件: r-prerel(arm64):混合内核_0.9-1.tgz,r-release(arm64):不可用,r-oldrel(arm64):混合内核_0.9-1.tgz,r-prerel(x86_64):混合Kernel_0.9-1.tgz,r-release(x86_64):不可用
旧来源: mixKernel存档

链接:

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