lilikoi:代谢组学个性化路径分析工具

代谢组学数据的综合分析工具。它由多种功能模块组成,包括几个新模块:用于归一化和插补的预处理模块、用于降维和变异源分析的探索性数据分析模块、具有新的深度学习方法和其他机器学习方法的分类模块,具有基于cox-PH和神经网络的cox-nnet方法的预后模块,以及可视化通路并解释代谢物通路关系的通路分析模块。参考文献:H.Paul Benton<http://www.metabolomics-forum.com/index.php?主题=281.0>杰夫·夏<https://github.com/cangfengzhe/Metabo/blob/master/Metabo分析师/网站/name_match.R>Travers Ching、Xun Zhu、Lana X.Garmire(2018)<doi:10.1371/journal.pcbi.1006076>.

版本: 2.1.1
取决于: R(≥3.5.0)
进口: 汽车,插入符号,数字播放器,千兆字节,ggplot2,格尔姆奈特,,插补,信息提奥,利马,M3C公司,度量标准,MLmetrics公司,平行,主曲线,路径视图,普利尔,预处理核心,pROC公司,RCy3号机组,网状的,重塑,RWeka公司,规模,统计,字符串,监督员,生存
建议: 针织物,rmarkdown公司
出版: 2005年2月2日
作者: 方欣英[aut],于柳[aut],任志杰[aut],Fadhl Alakwaa[奥特],黄思嘉[aut],拉娜·加米尔[aut,cre]
维护人员: Lana Garmire<Lana.gamire.group在gmail.com上>
许可证: GPL-2型
需要编译:
引用: lilikoi引文信息
材料: 自述文件 新闻
在视图中: Missing数据,组学
CRAN检查: lilikoi结果

文档:

参考手册: 利利科伊.pdf
渐晕图: 利利科伊V2.0

下载:

程序包来源: lilikoi_2.1.1.tar.gz公司
Windows二进制文件: r-预发布:lilikoi_2.1.1.zip文件,r版本:lilikoi_2.1.1.zip文件,r-oldrel:lilikoi_2.1.1.zip文件
macOS二进制文件: r-prerel(arm64):lilikoi_2.1.1.tgz,r-release(arm64):lilikoi_2.1.1.tgz,r-oldrel(arm64):百合科i_2.1.1.tgz,r-prerel(x86_64):lilikoi_2.1.1.tgz,r-release(x86_64):lilikoi_2.1.1.tgz
旧来源: 利利科伊档案馆

链接:

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