liger：轻量级迭代基因集丰富

基因集富集分析（GSEA）是一种计算方法，用于确定一组先验定义的基因是否在两种生物状态之间显示出统计意义上的一致差异。原始算法在Subramanian等人中有详细介绍，可通过Broad Institute获得“Java”实现（Subramania等人，2005年<doi:10.1073/pnas.0506580102>). “liger”软件包在一系列数值上提供了该浓缩测试的轻量级R实现（Fan等人，2017年<doi:10.5281/zenodo.887386>). 给定一系列值，例如差异表达分析或其他比较生物状态的分析得出的p值或对数变化，此软件包使您能够测试一组先验定义的基因以进行富集，从而能够解释高度显著或高度折叠变化的基因。

版本：	2.0.1
取决于：	R（≥2.10）
进口：	图形、统计、，卢比,矩阵统计，平行
链接到：	卢比,RcppArmadillo公司
建议：	针织物,rmarkdown公司,测试那个
出版：	2021-01-25
作者：	让·范[自动，cre]，彼得·哈尔琴科
维护人员：	Jean Fan<jhu.edu的jeanfan>
错误报告：	https://github.com/JEFworks/liger/issues
许可证：	GPL-3型|文件许可证
网址：	https://github.com/JEFworks/liger
需要编译：	对
引用：	liger引文信息
材料：	自述文件 新闻
在视图中：	组学
CRAN检查：	liger结果

文档：

参考手册：	liger.pdf格式
渐晕图：	用LIGER进行基因集富集分析 解释liger结果 探索排列P值 利用模拟突出基因集富集分析的威力

下载内容：

包源：	利格_2.0.1.tar.gz
Windows二进制文件：	r-devel公司：liger_2.0.1.zip拉链，r版本：liger_2.0.1.zip拉链，r-oldrel：liger_2.0.1.zip拉链
macOS二进制文件：	r释放（arm64）：锂2.0.1.tgz，r-oldrel（arm64）：锂2.0.1.tgz，r-release（x86_64）：锂2.0.1.tgz，r-oldrel（x86_64）：锂2.0.1.tgz
旧来源：	liger存档

反向依赖关系：

反向进口：

STdeconvolve公司

链接：

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