lfmm:潜在因素混合模型

快速准确地推断全基因组研究中的基因-环境关联(Caye等人,2019年<doi:10.1093/molbev/msz008>). 我们开发了一种用于混杂因素和效应大小的最小二乘估计方法为几类基因组数据提供独特框架的估计,不限于基因型。新算法的速度比现有的GEA方法快几倍,然后是“LEA”包中的“LFMM”程序的前一版本(Frichot和Francois,2015年<doi:10.111/2041-210X.12382>).

版本: 1.1
取决于: R(≥3.2.3)
进口: foreach公司,rmarkdown公司,针织物,MASS(质量),R光谱,统计,ggplot2,阅读器、方法、,呜呜声,卢比
链接到: RcppEigen基因,卢比
建议: 测试那个
出版: 2021-06-30
作者: 巴兹勒·朱门蒂埃[aut,cre],凯文·凯伊,奥利维尔·弗朗索瓦
维护人员: Basile Jumentier<Basile.Jumentier at gmail.com>
错误报告: https://github.com/bcm-uga/lfmm/issues
许可证: GPL-3型
需要编译:
CRAN检查: lfmm结果

文档:

参考手册: lfmm.pdf格式
渐晕图: R包概述lfmm

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旧来源: lfmm存档

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