kibior:一个简单的数据管理和共享工具

基于Elasticsearch(ES)API的存储、检索、搜索、连接和共享数据集的接口。作为一个分散、公平和协作的搜索引擎和数据库工作,它提出了一种仅基于ES的简单推/拉/搜索机制,ES是一种几乎可以部署在任何硬件上的工具。它是一种高级R-ES绑定,使用“弹性”包简化数据使用(S.Chamberlain(2020))<https://docs.ropensci.org/弹性/>,从“dplyr”包扩展连接(H.Wickham等人(2020))<https://dplyr.tidyverse.org/>并将特定的生物格式输入与生物导体软件包(如“rtracklayer”)相结合(M.Lawrence和al.(2009)<doi:10.1093/bioinformatics/btp328>) <http://bioconductor.org/packages/rtracklayer>《生物串》(H.Pagès等人(2020年)<doi:10.18129/B9.bioc。生物管柱>) <http://bioconductor.org/packages/Biostrings网站>和“Rsamtools”(M.Morgan等人(2020))<doi:10.18129/B9.生物。Rsamtools软件>) <http://bioconductor.org/packages/Rsamtools>,但也有一长串与“rio”更常见的单词(C-h.Chan和al.(2018))<https://cran.r-project.org/package=rio>.

版本: 0.1.1
取决于: R(≥4.0)
进口: R6级(≥2.5.0),数据表(≥ 1.13.2),字符串(≥ 1.4.0),呜呜声(≥ 0.3.4),jsonlite公司(≥ 1.7.1),里约(≥ 0.5.16),易怒的(≥ 3.0.4),dplyr公司(≥ 1.0.2),马格里特(≥ 1.5),第三年(≥1.1.2),有弹力的(≥ 1.1.0),生物管柱,Rsamtools软件,rtracklayer公司
建议: ggplot2(≥ 3.3.2),阅读器(≥1.4.0),xml语言2(≥ 1.3.2),山药(≥ 2.2.1),测试那个(≥ 3.0.0),rmarkdown公司(≥ 2.5),针织物(≥1.30)
出版: 2021-01-28
作者: 雷吉斯·翁加罗·卡西ORCID标识[aut、cre、,ctb],阿诺·德罗特(Arnaud Droit)[fnd]
维护人员: Régis Ongaro-Carcy<regis.Ongaro-carcy2 at crchudequebec.ulaval.ca>
错误报告: https://github.com/regisoc/kibior/issues
许可证: GPL-2型
网址: https://github.com/regisoc/kibior网站
需要编译:
引用: kibior引文信息
材料: 自述文件
CRAN检查: kibior结果

文档:

参考手册: kibior.pdf格式
渐晕图: kibior生物示例
kibior_简介

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旧资料来源: 基比奥档案

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