iq:基于质谱的蛋白质组学中的蛋白质定量

MaxLFQ算法的实现Cox等人(2014)<doi:10.1074/mcp。M113.031591>全面以数据相关采集模式处理蛋白质组数据的管道(Pham等人,2020年<doi:10.1093/bioinformatics/btz961>).它提供了使用N个最强烈的碎片离子,使用所有碎片离子,以及Tukey(1977,ISBN:021076160)的中值抛光算法包装器。通常,该工具可用于集成多个按比例观察到单个定量值。

版本: 1.9.12
取决于: R(≥2.10)
链接到: 卢比,RcppEigen基因
建议: 针织物,rmarkdown公司
出版: 2023-12-06
作者: Thang Pham公司ORCID标识[自动,cre、cph、ctb],亚历克斯·亨尼曼ORCID标识【ctb】
维护人员: Thang Pham<阿姆斯特丹的t.Pham
错误报告: https://github.com/tvpham/iq/issues网站
许可证: BSD_3_条款+文件许可证
网址: https://github.com/tvpham/iq
需要编译:
引用: 智商引文信息
在视图中: 组学
CRAN检查: 智商结果

文档:

参考手册: iq.pdf格式
渐晕图: 快速最大LFQ
iq:基于DIA-MS的蛋白质组学中通过离子定量估计相对蛋白质丰度的R包

下载内容:

包源: iq_1.9.12.tar.gz
Windows二进制文件: r-预发布:iq_1.9.12.zip版本,r版本:iq_1.9.12.zip码,r-oldrel:iq_1.9.12.zip码
macOS二进制文件: r-prerel(arm64):iq_1.9.12.tgz,r-release(arm64):iq_1.9.12.tgz,r-oldrel(臂64):iq_1.9.12.tgz,r-prerel(x86_64):iq_1.9.12.tgz,r-release(x86_64):iq_1.9.12.tgz
旧来源: 智商档案

反向依赖关系:

反向建议: 普罗蒂

链接:

请使用规范形式https://CRAN.R-project.org/package=iq链接到此页面。