ibdsim2:模拟家族成员共享的染色体区域

通过谱系成员。使用性别特异性重组率人类基因组(Halldorson等人(2019)<doi:10.1126/science.aau1043>),相控染色体被模拟用于所有家族成员。应用包括计算已实现相关系数和IBD段分布。”ibdsim2'是“ped套件”的一部分,用于系谱分析。“ped套件”的详细介绍,包括一个单独的关于“ibdsim2”的章节,可在《系谱分析》一书中找到R’(维格兰,2021,ISBN:9780128244302)。用于可视化的“闪亮”应用程序和比较IBD分布可在<https://magnusdv.shinyapps.io/ibdsim2-闪亮/>.

版本: 2.0.0
取决于: R(≥4.1.0),徒步工具(≥ 2.2.0)
进口: 卢比,ggplot2,,肋骨(≥ 1.5.0)
链接到: 卢比
建议: 测试那个
出版: 2023-08-17年
作者: Magnus Dehli Vigeland公司ORCID标识[aut,cre]
维护人员: Magnus Dehli Vigeland<m.d.Vigeland at medisin.uio.no>
许可证: GPL-3公司
网址: https://github.com/magnusdv/ibdsim2,https://magnusdv.github.io/编辑套件/,https://magnusdv.shinyapps.io/ibdsim2-闪亮/
需要编译:
语言: en-GB公司
材料: 自述文件 新闻
CRAN检查: ibdsim2结果

文档:

参考手册: ibdsim2.pdf格式

下载:

程序包来源: ibmsim2_2.0.0.tar.gz
Windows二进制文件: r-预发布:ibmsim2_2.0.0.zip,r版本:ibmsim2_2.0.0.zip,r-oldrel:ibdsim2_2.0.0.zip版本
macOS二进制文件: r-prerel(arm64):ibmsim2_2.0.0.tgz,r-release(arm64):ibmsim2_2.0.0.tgz,r-oldrel(arm64):ibmsim2_2.0.0.tgz,r-prerel(x86_64):ibmsim2_2.0.0.tgz,r-release(x86_64):ibmsim2_2.0.0.tgz
旧来源: ibdsim2存档

反向依赖关系:

反向进口: 小贩
反向建议: 福雷尔

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