genBaRcode:遗传条形码数据的分析和可视化工具

提供必要的功能,以识别和提取现有条形码结构的选择(Cornils,K.等人(2014))<doi:10.1093/nar/gku081>)以及从下一代序列(NGS)数据中自由选择条形码设计。此外,它还提供了解释序列错误、计算条形码相似性的可能性,并提供了各种可视化工具(Thielecke,L.等人(2017))<doi:10.1038/srep43249>).

版本: 1.2.7
取决于: R(≥3.4)
进口: 方法,RColorBrewer公司,,GG网络,ggplot2,gggraph图,记录仪,网络,潘贡,字符串主义者,可视网络,重塑2,S4载体,闪亮的,ggtree(ggtree),数字播放器,维恩图,futile.logger,未来,未来应用程序、工具、,ShortRead(短阅读),生物串
建议: 生物技术经理,测试那个,针织物,rmarkdown公司
出版: 2023-12-11
作者: 拉尔斯·蒂莱克
维护人员: 拉尔斯·泰莱克(Lars Thielecke)
许可证: LGPL-2型|LGPL-2.1型|LGPL-3型[扩展自:LGPL]
需要编译:
CRAN检查: genBaR代码结果

文档:

参考手册: genBaR代码.pdf
渐晕图: genBaRcode GUI简介
genBaRcode简介

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macOS二进制文件: r-prerel(arm64):genBaR代码_1.2.7.tgz,r-release(arm64):genBaR代码_1.2.7.tgz,r-oldrel(arm64):genBaR代码_1.2.7.tgz,r-prerel(x86_64):genBaR代码_1.2.7.tgz,r-release(x86_64):genBaR代码_1.2.7.tgz
旧来源: genBaR代码存档

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