effectorR:预测卵菌效应器

通过使用正则表达式搜索和基于Haas等人(2009)的隐马尔可夫模型(HMM)搜索感兴趣的基序,使用基因组数据预测细胞质效应蛋白<doi:10.1038/nature08358>.

版本: 1.0.2
取决于: R(≥3.5.0)
进口: 顺序(≥ 3.3.6),ggplot2(≥ 2.2.1),闪亮的,重塑2,实用程序,rmarkdown公司,翡翠色
建议: 针织物,测试那个
出版: 2018-09-30
作者: 哈维尔·塔比玛[aut,cre],Niklaus J.Grunwald[思]
维护人员: 哈维尔·塔比玛(Javier Tabima)
许可证: GPL-2型|GPL-3公司
需要编译:
材料: 自述文件 新闻
CRAN检查: effectorR结果

文档:

参考手册: 效果R.pdf
渐晕图: effectorR:一个称为卵菌效应器的R包

下载:

包源: 效应R_1.0.2.tar.gz
Windows二进制文件: r-预发布:effectR_1.0.2.zip(效应R_1.0.2.zip),r版本:有效R_1.0.2.zip,r-oldrel:effectR_1.0.2.zip(效应R_1.0.2.zip)
macOS二进制文件: r-prerel(arm64):效应R_1.0.2.tgz,r-release(arm64):效应R_1.0.2.tgz,r-oldrel(arm64):效应R_1.0.2.tgz,r-prerel(x86_64):效应R_1.0.2.tgz,r-release(x86_64):效应R_1.0.2.tgz
旧来源: effectR存档

链接:

请使用规范形式https://CRAN.R-project.org/package=effectR链接到此页面。